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原创 DispSeq的背景知识与分析;MACS用narrow还是board模式

intrinsically disordered regions,内在无序区域:是蛋白质结构的一个概念,其在溶液中没有固定的空间结构,处于被动的、无序的状态。👉本质是氨基酸序列。①对DisP-seq峰进行无偏倚motif分析,识别转录因子的富集情况,并用western blot检测b-isox对这些TFs的沉淀作用👉找到无序蛋白会结合的TFs。我第一次分析H3K27ac的ChIP-seq数据的时候,MACS3用的是board模式,出来的峰极少,后来发现需要用narrow模式。故用的narrow。

2025-07-08 15:20:06 1780

原创 KEGG.db安装

官网让先source biocLite,然后再使用biocLite安装。R4.5,BiocManager1.30直接安装会报错。想着是官网的推荐,再试了一遍还是不行。找到source文件,wget下载下来。再进入R,输入文件所在地址,手动安装。

2025-07-06 14:37:50 771

原创 error while loading shared libraries: libcrypto.so.1.0.0: cannot open shared object file解决

有1.1版本,那就直接在该目录下建立软连接,使得需要用1.0版本的时候,直接带调用这个1.1的。cd到该目录的上一级的lib文件夹,查看有无1.1版本。哪个程序报错就which一下,看看具体路径。今日份报错,mark。

2025-07-05 19:58:03 551

原创 R包安装CXX11 is not defined 解决

【代码】 R包安装CXX11 is not defined 解决。

2025-06-26 22:20:46 120

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