【基因组学】非编码RNA基础-microRNA

1历史

2000年左右的时候，有五六个物种的基因组已经被测通了。
从1993年的线虫，到2000年植物、动物中，

DAN转录后得到pri-miRNA,长度为几千个碱基，根据放大后的结构，我们称之为颈环结构或发卡结构。

pri-miRNA经过Drosha这个蛋白切割以后，变成了60-70个碱基长度，称作pre-miRNA，前体RNA 。

然后，被EXportin5等，从细胞核运送到细胞质当中。

经过Diver把环给切掉，保留两个茎，称作双链小RNA。双链解体后的每一个茎，都称作一个单独的miRNA,有的把其中的一条降解掉，有的都保留。对于生成2条miRNA的，按照常规的顺序，5’端的那个，我们叫做microRNA-5p,3’端的那个叫做microRNA-3p

成熟的microRNA在细胞质中主要有两个作用，在形成一个装配的miRISC（和蛋白一起的复合物）后
1、不完全匹配结合在3’ UTR（3‘ 非翻译区）,抑制靶基因蛋白翻译（含有这个区的序列如mRNA，在结合microRNA以后，抑制它的蛋白质翻译过程。mRNA在转录水平上没有发生变化，但是在翻译水平上发生了变化，被抑制了）
2、完全匹配以后，靶基因mRNA降解掉了。（mRNA从有到无，是在转录水平上发生的变化）

注意，下面这个作用机理的图比较老了，最新的作用更多，还可以进入核内起到作用，后续再提。

miRNA身体内无处不在，miRNA具有靶向作用，例如靶向某个目标器官。miRNA很小，小到RNA也不愿意去光顾它。因此它存在于几乎所有的体液中。

我们研究基因知道，我们想看基因的信息，就去NCBI去查，如果进一步想看转录本的信息呢，就去gene car等其他参考网站。

对于miRNA而言，我们要来的第一个网站就是这个


5p是因为，茎环结构的茎分为两条，每条都可以生成一条miRNA，其中从5’到3’是我们常见的，因此左边的茎我们叫5p，右边的叫3p，如果只保留一条我们就不写5p还是3p了。

外链部分说明了miRNA调控哪些靶基因。因为miRNA自身是不编码的，它只能通过调控靶基因起作用。

2机制

1、抑制mRNA翻译
2、切割mRNA
3、降解mRNA （最主要的作用，结合miRNA后，mRNA被降解成核苷酸了）mRNA和miRNA是多对多的关系

hsa代表物种，mir代表是前体，还不是成熟体，它有三个来源， 19a和19b代表来自不同的染色体，miR大写就是成熟的miRNA了，

3高通量技术与microRNA