韦恩图绘制的常用工具

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#可视化 #韦恩图 #多组数据交集

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本文介绍了用于分析多个数据集间交集的常用R包及其在线工具，包括适用于5个集合内的VennDiagram包和EulerAPE，以及适用于5个以上集合的InteractiVenn、VENNDIAGRAMS和UpSetR包。这些工具帮助研究人员直观地展示复杂的数据关系。

var1	var2	var3	var4	var5	var6
col1	col1	txx	moive	xx	col5
col2	s	col1	n	col5	music
col3	n	s	col1	love	ada
s	ada	col3	col10	chri	n
col5	love	xx	col2	n	alpha

针对多组数据找彼此间的交集（intersection），常用的R包：
1. 小于等于5 个集合：
VennDiagram包
使用教程：http://blog.qiubio.com:8080/archives/2603
或者使用其在线工具：http://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html

EulerAPE

2.大于5个集合：
InteractiVenn(2-6 set data): http://www.interactivenn.net/

Heberle, H.; Meirelles, G. V.; da Silva, F. R.; Telles, G. P.; Minghim, R. InteractiVenn: a web-based tool for the analysis of sets through Venn diagrams. BMC Bioinformatics 16:169 (2015).

VENN DIAGRAMS(2-6 set data): http://bioinformatics.psb.ugent.be/webtools/Venn/
http://bioinformatics.psb.ugent.be/beg/tools/venn-diagrams
http://bioinformatics.psb.ugent.be/beg/

UpSetR包
或者使用其在线工具：http://vcg.github.io/upset/

#Download
#Install the latest released version from CRAN
install.packages("UpSetR")

#Download the latest development code of UpSetR from GitHub using devtools with
devtools::install_github("hms-dbmi/UpSetR")