KeyarchOS适配MaterialsStudio

  1. Materials Studio是专门为材料科学领域研究者开发的一款可运行在PC上的模拟软件,由美国Accelrys公司生产。它是新一代的材料计算软件,能够帮助研究者构建、显示和分析分子、固体及表面的结构模型,并研究、预测材料的相关性质。该软件支持Windows 98、2000、NT、Unix以及Linux等多种操作平台,使化学及材料科学的研究者们能更方便地建立三维结构模型,并对各种晶体、无定型以及高分子材料的性质及相关过程进行深入的研究,详情介绍见官网链接BIOVIA Materials Studio | Dassault Systèmes

  2. 安装准备 2.1 操作系统环境 版本信息:KeyarchOS 5.8 硬件平台:X86_64

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2.2 版本 MaterialsStudio2020 厂商名称:美国Accelrys公司(现已被Biovia公司收购)

  1. 下载 链接:百度网盘 请输入提取码 提取码:yku2

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  1. 安装

  2. 安装前准备

  • 关闭防火墙和SELINUX,命令如下: systemctl stop firewalld systemctl disable firewalld sed -i 's/^SELINUX=.*$/SELINUX=disabled/' /etc/selinux/config setenforce 0

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  • 提前安装以下插件,命令:yum -y install gcc gcc-c++ gcc-gfortran libnsl csh redhat-lsb-core httpd

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  1. 开始安装

  • 创建软件夹ms2020,将下载的压缩包放在软件夹下,并解压“tar -xvf BIOVIA_2020.MaterialsStudio2020.tar”

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  • 进入压缩文件,执行安装的执行文件 install,按照下面图中所示填写,按enter键可选择默认值,出现第三张图所示内容表示安装成功

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  1. 修改破解文件,执行文件

  • 将下载的文件中的破解文件,和执行文件复制到对应路径,赋权

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执行可执行文件

  1. 配置

  • 查看系统的hostname,并将预先准备好的msi2020.lic(licence文件)中第一行hostname部分替换成系统的hostname

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  • 给Gateway用户更新密码,出现以下内容表示更新成功,命令如下: //切换到Gateway文件夹下 cd /ms2020/MaterialsStudio20.1/etc/Gateway //查看用户并更新Gateway用户密码 ./gwusers -list ./gwusers -update gatekeeper

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  • 设置开机自启动,命令如下: //复制文件到目录 cp msgateway_control_18888 /etc/rc.d/init.d/ chkconfig --add msgateway_control_18888

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重启查看状态是否正常

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  1. 访问测试网页

  • 访问测试网址IP+端口18888(具体访问网址为安装过程中显示内容,如下图)

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浏览器访问显示如下内容,表示安装成功

1.1量子力学方法 1.1.1 CASTEP CASTEP由Cambridge大学Mike Payne教授发布,采用密度泛函理论、平面波赝势法(用平面波描述外层价电子,内层电子用赝势代替),进行第一性原理量子力学计算的程序。其中总能量包含动能、静电能和交换关联能三部分,各部分能量都可以表示成密度的函数。电子与电子相互作用的交换和相关效应采用局域密度近似(LDA)或广义密度近似(GGA),静电势只考虑作用在系统价电子的有效势(即赝势:Ultrasoft 或norm-conserving),电子波函数用平面波基组扩展(基组数由Ecut-off确定),电子状态方程采用数值求解(积分点数由FFT mesh确定),电子气的密度由分子轨道波函数构造,分子轨道波函数采用原子轨道的线性组合(LCAO)构成。计算总能量采用SCF迭代。CASTEP在计算分子、固体、表面、界面、掺杂、错位等方面非常有优势。 主要功能及特性:  支持 PBE、PBE0、HSE03、HSE06以及SCAN meta-GGA 等交换关联泛函;  能量计算:形成能、吸附能、缺陷形成能、内聚能、表面能等;  结构优化:力与应力的计算、几何驰豫(原子坐标、晶胞参数、键长、键角、)等;  过渡态:过渡态搜索等;  电子结构:能带、态密度(局域、分波)、声子谱、电荷密度、差分电荷密度、电子局域函数、电子轨道、扫描隧道显微镜STM模拟、共价键级、静电势(支持可视化)、静电荷(Mulliken、Hirshfeld)、功函数、自旋极化(共线、非共线)、支持旋轨耦合、费米面、支持利用On-the-fly 生成模守恒(normconserving)赝势,特别适用于计算磁性材料和包含f电子的元素;  介电性质:波恩有效电荷、静态介电常数张量、极化率张量;  力学性质:弹性力常数张量,体模量,剪切模量,杨氏模量,泊松比;热力学性质:声子态密度、色散谱、熵、焓、自由能、零点能、德拜温度、等容热容随温度的变化曲线;  光学性质:红外光谱、拉曼光谱5.0、核磁共振谱(NMR CASTEP,可用DFT+U)、电子能量损失谱4.4(旋轨耦合效应5.5)、X射线吸收谱4.4(旋轨耦合效应5.5)、光频介电常数虚(实)部、吸收系数、折射率、能量损失函数、光导率虚(实)部;  动力学计算:支持NVE、NVT、NPT以及NPH等系综,以及多种控温控压函数;
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