microbiomeSeq是一个环境微生物群落分析的多功能R包,可分析项目如下图。
一个如此强大的R包,却由于一些技术原因没有被录入到CRAN库中,不能直接通过instal.packages()安装。在网上搜索到的microbiomeSeq的方法都是linux系统的安装方法。以下是我找到的在windox系统安装microbiomeSeq的可行办法,R版本是4.3:
remotes::install_github("cran/KMDA")
library(devtools)
install_github("umerijaz/microbiomeSeq")。
最后一步安装过程可能会出现warning,这可能因为缺少相关依赖包,我们根据warning把缺失相关依赖包安装好再进行再运行install_github("umerijaz/microbiomeSeq")命令即可。由于安装完关闭了程序,没得截图供参考。希望对大家有用。