微生物群落分析多功能R包microbiomeSeq安装

文章介绍了microbiomeSeq,一个用于环境微生物群落分析的R包,以及在Windows系统上安装该包的步骤,包括使用remotes和devtools包从GitHub安装,并处理可能出现的依赖问题。

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microbiomeSeq是一个环境微生物群落分析的多功能R包,可分析项目如下图。

一个如此强大的R包,却由于一些技术原因没有被录入到CRAN库中,不能直接通过instal.packages()安装。在网上搜索到的microbiomeSeq的方法都是linux系统的安装方法。以下是我找到的在windox系统安装microbiomeSeq的可行办法,R版本是4.3:

remotes::install_github("cran/KMDA")

library(devtools)

install_github("umerijaz/microbiomeSeq")。

最后一步安装过程可能会出现warning,这可能因为缺少相关依赖包,我们根据warning把缺失相关依赖包安装好再进行再运行install_github("umerijaz/microbiomeSeq")命令即可。由于安装完关闭了程序,没得截图供参考。希望对大家有用。

 

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