在医学影像处理中,坐标系的概念和转换是非常重要的。ITK(Insight Segmentation and Registration Toolkit)是一个强大的开源图像分割和配准工具包,提供了广泛的功能来处理医学影像数据。
本文将讨论一些与医学影像坐标系相关的问题,并提供相应的代码示例。首先,我们将介绍ITK中常用的坐标系表示方法,然后讨论如何进行坐标系之间的转换。
- 坐标系表示方法
在ITK中,常用的坐标系表示方法包括物理坐标系(Physical Space)和像素坐标系(Index Space)。
物理坐标系是指以真实世界中的物理单位表示的坐标系,比如以毫米或厘米为单位的空间位置。而像素坐标系是以像素为单位表示的坐标系,它表示了图像或体积数据中每个像素的位置。
在ITK中,可以使用以下代码获取图像的物理坐标系和像素坐标系:
import itk
# 读取图像
image = itk.imread("image.nii.gz")
# 获取物理坐标系
origin = image.GetOrigin()
spacing = image.GetSpacing()
# 获取像素坐标系
size = image.GetLargestPossibleRegion().GetSize()
- 坐标系转换