人类基因统计信息

最新推荐文章于 2025-02-11 16:20:16 发布

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#基因统计 #染色体分析 #全基因组

本文介绍了不同类型的非编码RNA，包括snoRNA、snRNA、rRNA、scRNA、TERC、small ncRNA（miRNA和siRNA）、lncRNA等，并提供了最新的人类miRNA基因和成熟miRNA数量统计，总数分别为3043个和2588个。

摘要生成于 C知道，由 DeepSeek-R1 满血版支持，前往体验 >

以前的统计

项目	特征
基因组大小	$3.2×1093.2\times10^9$ bp
常染色质	92%
蛋白质编码序列	1.1%~1.4%
RNA编码序列	28%
内含子序列	2

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从Ensemble来源的基因注释信息抓取人类基因组上5号染色体的编码miRNA基因并统计数量

Zephyr_Hu的博客

05-23

1986

1.首先得到人类基因组注释文件并解压 wget -c ftp://ftp.ebi.ac.uk/pub/databases/gencode/Gencode_human/release_29/gencode.v29.annotation.gtf.gz gunzip -f gencode.v29.annotation.gtf.gz 2.从中抓取出5号染色体的注释信息并新建一个注释文件 grep chr...

全基因组关联分析（GWAS）-统计方法与模型简介

wyhua2008的博客

11-01

2302

是对多个个体在全基因组范围的遗传变异（标记）多态性进行检测，获得基因型，进而将基因型与可观测的性状，即表型，进行群体水平的统计学分析，根据统计量或显著性 p 值筛选出最有可能影响该性状的遗传变异（标记），挖掘与性状变异相关的基因。当位于某一座位的特定等位基因与另一座位的某一等位基因同时出现的概率大于群体中因随机分布的两个等位基因同时出现的概率时，就称这两个座位处于连锁不平衡状态（linkage disequilibrium）• 令Yi为第i个个体的质量性状的表型值Yi = {0,1};

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人类基因（human）

liankewei的博客

09-13

511

题目描述上了大学之后，小W和小Z一起报了一门三宝课，在实践课上遇到了一些问题。一条染色体上有nn对基因，每种基因都可以用一个数ai来表示，作为标号。现在，在其中一条染色单体上某基因发生了突变。此时染色体上有n−1对相同的基因和一对不同的基因。他们通过某种方法获得了这条染色体上的全部基因。现在他们想知道发生突变的基因的标号是什么。输入第一行一个数n ...

人类基因组参考基因组

Keep Learning

01-08

6777

人类基因组参考基因组： GRCh38下载地址： ftp://ftp.1000genomes.ebi.ac.uk/vol1/ftp/technical/reference/GRCh38_reference_genome/ 使用以上数据的有： https://github.com/chapmanb/cloudbiolinux/blob/master/ggd-recipe

人类DNA国标-中英对照表

HeJD的博客

04-18

5218

中英对照表字段英文对应数据类型英文平均碱基对长度 AverageBasePairSize 碱基数据 BaseData 碱基数据类型 BaseDataType 碱基对长度 BasePairSize 碱基读出 BaseRead 碱基类型 BaseType ...

CRISPR最新：新CRISPR技术靶向更复杂的人类基因组代码

Bio12345的博客

02-26

380

Rice大学的研究人员通过一种新的基因组编辑工具取得了类似的成就，这种工具的目标是细胞核中的辅助角色，这些角色负责包装DNA并帮助基因表达。他们的工作为癌症和其他疾病的新疗法打开了大门。 Rice生物工程师Isaac Hilton，第一作者Jing Li博士后研究员和他们的同事设计了一个改良的CRISPR/Cas9复合物，以靶向特定的组蛋白。组蛋白有助于调节许多细胞过程。每个核小体中有四个（DNA中基本的“串珠”），通过暴露基因进行激活，帮助控制我们基因组的结构和功能。 Hilton..

人类基因组版本：hg19和hg38

SN的博客

12-23

6947

是于2013年发布的人类基因组版本，也被称为GRCh38（Genome Reference Consortium human genome build 38）。是于2009年发布的人类基因组版本，也被称为GRCh37（Genome Reference Consortium human genome build 37）。（人类基因组版本38）都是人类基因组的版本号。有一些改进，包括更好地解决了基因组的一些难以映射的区域、更全面的注释等。（人类基因组版本19）和。

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12-21

人类参考基因组是生物学研究中的核心资源，它代表了人类基因组的标准模板，用于比较、分析和理解个体或群体的遗传信息。这个基因组是由科学家们通过人类基因组计划（Human Genome Project）在2001年初步绘制的，旨在...

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人类基因组中HOT区域的全基因组鉴定和表征。

03-25

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02-11

543

计算基因长度是基因组分析的重要环节，需谨慎处理数据源、计算方法和基因模型定义。通过对具体案例的分析，可以更好地理解基因长度计算的复杂性和重要性。

人全外显子组测序WES学习笔记第一天

qq_45822116的博客

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2265

**人全外显子组测序WES学习笔记第一天一.基础知识 1.名词释义外显子：外显子 (expressed region) 是真核生物基因的一部分，它在剪接 (Splicing) 后仍会被保存下来，并可在蛋白质生物合成过程中被表达为蛋白质。外显子是最后出现在成熟 RNA 中的基因序列，又称表达序列。既存在于最初的转录产物中，也存在于成熟的 RNA 分子中的核苷酸序列。在人类基因中大约有 180,000 外显子，占人类基因组的 1%，约 30 MB。外显子组：基因组中的全部外显子称为外显子组。全外显子

生信技能树-task1-人类基因组外显子区域长度

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09-07

1125

目标：统计人类基因组外显子区域长度题目数据来源为：ftp://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/pub/CCDS/current_human/CCDS.current.txt perl实现 open F,"CCDS.current.txt"; while(<F>){#一行一行读取数据 next if /^#/;#pass掉带#符号开头的行，即首行 chomp;#去掉末尾的换行符 @arr=split /\t/;#以制表符切割读取的每一行数据 next unles

基因丰度统计

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4804

基因丰度计算使用soap将clean data比对到非冗余的核酸序列NonRundant.gene.nucl.fasta。根据soap比对结果，获得比对到某基因的read数。Soap比对工具的使用在之前的微信推送稿中介绍过，这里就不做说明。然后，基于read数获得基因的丰度值，计算方法如下： S1 S2 S3 ...

计算基因组外显子长度

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01-09

2075

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weixin_34143774的博客

07-21

2314

要求实现这个功能的软件也很多，还是烦请大家先自己搜索几个教程，入门请统一用htseq-count，对每个样本都会输出一个表达量文件。需要用脚本合并所有的样本为表达矩阵。参考：生信编程直播第四题：多个同样的行列式文件合并起来对这个表达矩阵可以自己简单在excel或者R里面摸索，求平均值，方差。看看一些...

基因组统计分析：N50、Contig数量与长度指标

例如，对于人类基因组的参考序列，高N50值和较少的contigs数量通常意味着该序列更加完整，更能够反映真实的人类遗传多样性和复杂性。 4. 统计分析工具为了完成基因组组装的统计分析，研究人员通常会使用一些专门的...