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RSS订阅原创 蛋白质3D建模等变神经网络、李群SE(3)
Alphafold2之前， 使用神经网络去直接优化蛋白标量 距离图， 采样低能量构象。Alphafold2: 直接对3D建模，用等变神经网络去直接获得原子水平优化结果蛋白质表示为G=(V,E,N,R)G = (V, E, N, R)G=(V,E,N,R)VVV 表示有序的图节点（可以是氨基酸/原子）E∈V×VE \in V \times VE∈V×V 表示相应的边集合每个节点v∈Vv \in Vv∈V 都有标量和向量属性： nv=(Sv,Vv)∈Nn_v = (S_v, V_v) \in Nn
2023-07-26 15:55:48
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原创 流行病学基础
①横断面调查②监测③生态学研究→产生假设①病例对照②队列研究→检验假设①临床试验（RCT)②现场试验③社区干预（CIP）→验证假设。
2022-07-15 14:31:03
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原创 meta分析方法
一、选题新颖：别人没做过-比如中医药方面改变：对别人的结论纠正或补充Population: 研究对象Indicator: 干预措施Comparator: 对照组Outcome: 结果题目包含这四点就是合格题目。比如： 转基因玉米是否会引起人体不良反应的meta分析。二、文献检索及文献纳入流程图检索策略：检索式（（”sodium chloride"[MeSH Terms] OR (“sodium”[All Fields] AND “chloride”[All Fields]) OR …))
2022-07-10 10:46:18
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原创 超参数优化之贝叶斯优化（Bayesian Optimization)
文章目录Ⅰ.Grid Search/Random SearchⅡ.Bayesian OptimizationⅠ.Grid Search/Random SearchGrid Search:神经网络训练由许多超参数决定，例如网络深度、学习率、卷积核大小等等。为了找到一个最好的超参数组合，最直观的想法就是Grid Search, 其实也就是穷举搜索。Random Search:为了提高搜索效率，提出随机搜索。虽然随机搜索得到的结果互相之间差异较大，但是实验证明随机搜索的确比网格搜索效果要好Ⅱ.
2021-12-08 19:52:42
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原创 noncoding RNA as biomarker
Article SummaryNO.标题发表时间刊物IFSummary1Circulating miR-181 is a prognostic biomarker for amyotrophic lateral sclerosis2021.10.28nature neuroscience24.8作者通过252位ALS患者, RNA-seq，研究了血浆中细胞外miRNAs 作为ALS 预测biomarkers的潜能2Long Noncoding RNA MI
2021-12-01 09:23:44
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原创 Linux常用命令
命令格式命令格式： 命令 [-选项] [参数]例： ls -la /etc说明：当有多个选项时，可以写在一起，简化选项与完整选项，-a对于–all目录处理命令：ls命令名称：ls命令英文原意：list命令所在路径：/bin/ls执行权限：所有用户功能描述：显示目录文件语法：ls , ls -a(查看目录下的隐藏文件，.abc .defls / 查看目录下的文件ls -l 查看详细信息（long)ls -lh(human)-d 查看目录属性ls -i 查看目录i节点-rw
2021-11-29 19:45:11
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原创 R语言数据处理tricks
R语言数据处理tricks文章目录R语言数据处理tricks前言Tricks二、使用步骤1.引入库2.读入数据总结前言本文是关于R语言的一些常规操作，持续更新中。TricksOperationDescriptionrowMeans()average for row, eg. df1$Avg_score = rowMeans(df1[,c(2,3,4)])apply()df1$Avg_score = apply(df1[,-1], 1, mean) :
2021-11-04 15:03:48
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原创 Python 语法
Python 语法Ⅰ.draw graph1.组合小图成大图a.均匀作图import matplotlib.pyplot as pltplt.figure() #使用plt.figure 创建一个图像窗口plt.subplot(2,2,1) #将整个图像窗口分为2行2列，当前位置为1plt.plot([0,1],[0,1]) #在第一个位置创建一个小图plt.subplot(2,2,2) #分为2行2列，当前位置为2plt.plot([0,1],[0,2]) #在第二个位置创建一个
2021-11-02 14:34:08
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原创 正则表达式
这里写自定义目录标题欢迎使用Markdown编辑器新的改变功能快捷键合理的创建标题，有助于目录的生成如何改变文本的样式插入链接与图片如何插入一段漂亮的代码片生成一个适合你的列表创建一个表格设定内容居中、居左、居右SmartyPants创建一个自定义列表如何创建一个注脚注释也是必不可少的KaTeX数学公式新的甘特图功能，丰富你的文章UML 图表FLowchart流程图导出与导入导出导入R语言之正则表达式 -----------------------------------------------------
2021-10-19 16:31:33
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空空如也
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