启动eclipse里面的tomcat访问java类时报ClassNotFound

一直有个奇葩的问题在困扰着我：
在运行eclipse的Tomcat的时候，除了访问第一个项目是正常的，
访问后来创建的其他项目都无法访问java类，jsp什么的都正常，但是一访问java类就报ClassNotFound。但是运行外部tomcat又是正常的，什么问题没有。
找几个同事和在技术群里面问，都没人搞定，因为自己一直在做第一个创建的项目，其余的项目只是偶尔维护一下，开外部tomcat，也没怎么在意，随着第一个项目搞定了，项目越来越多，总不能一直开外部tomcat吧，虽然因为不能进断点学习了一个远程调试，但是不能自动编译，每次修改java类都需要重启，好吧，虽然能解决，但是我很懒，不把这个问题解决就不爽。于是自己捣鼓eclipse。
功夫不负有心人，在比对几个项目的properties无果后，我打开了eclipse的preference，意外的发现了tomcat菜单下有个Add java project to tomcat classpath下面只勾选了我第一个项目，感觉很对路的样子，忙把自己的项目全勾选了，然后接着找Source path，把那里面的也全勾选了，好吧，不管你对不对，反正我是全选了。然后忙着重启eclipse里面的tomcat，哈哈，成功了。
原理什么的暂时无法解释，去网上搜那几个选项，好像也没什么特别的解释，以后发现了再来补上吧，有谁发现了也请补上。thx:)))