将dicom文件转换为nrrd格式并保存，python

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本文介绍了一个Python脚本，该脚本可以将DICOM系列文件转换为NRRD格式。通过使用SimpleITK库读取DICOM系列并将其写入NRRD文件，此过程简化了医学图像处理工作流程。

import SimpleITK as sitk
import os


def dcmseries2nrrd(filepath, subName):
    datapath = os.path.join(filepath, subName)
    dcms_name = sitk.ImageSeriesReader.GetGDCMSeriesFileNames(datapath)
    dcms_read = sitk.ImageSeriesReader()
    dcms_read.SetFileNames(dcms_name)
    dcms_series = dcms_read.Execute()
    sitk.WriteImage(dcms_series, filepath + subName + '.nrrd')


filepath = "/Volumes/patient"
subName = '12345'
dcmseries2nrrd(filepath, subName)