Fortran OpenMP并行的Segmentation fault错误的解决

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已于 2022-06-15 17:13:49 修改 · 2.9k 阅读

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#云计算

于 2022-06-15 17:04:10 首次发布

博客作者在尝试将程序从256*256*192网格加密到512*256*192时遇到SegmentationFault错误。通过检查ulimit设置和对比超算的配置，作者发现可能是OpenMP线程栈空间不足导致的问题。在查阅资料后，了解到需要通过设置环境变量OMP_STACKSIZE来调整OpenMP线程栈大小。最终，通过设置OMP_STACKSIZE为1G解决了问题。

今天把原来256*256*192网格的程序加密到512*256*192的时候，进入并行时出现了Segmentation fault错误：

./run.sh: line 13: 95841 Segmentation fault (core dumped) ./rib00

根据经验，首先检查ulimit，执行

ulimit -a

结果

core file size (blocks, -c) 0
data seg size (kbytes, -d) unlimited
scheduling priority (-e) 0
file size (blocks, -f) unlimited
pending signals (-i) 2061342
max locked memory (kbytes, -l) 65536
max memory size (kbytes, -m) unlimited
open files (-n) 1024
pipe size (512 bytes, -p) 8
POSIX message queues (bytes, -q) 819200
real-time priority (-r) 0
stack size (kbytes, -s) unlimited
cpu time (seconds, -t) unlimited
max user processes (-u) 2061342
virtual memory