G-BLASTN: Accelerating Nucleotide Alignment by Graphics Processors论文提供下载

OpenHero OpenHero 博客等级 墨衍会员 · AI 创作全网分发 墨衍智能分发 本文由作者通过墨衍一键同步至各平台 1分发平台 6.5k累计阅读 6.5k平均单平台 已同步平台 优快云 微信公众号 微博 知乎 掘金 百家号 博客园 抖音 小红书 你的文章也可以这样分发 墨衍会员 ¥399起/年，写一次发全网 我也要 码龄23年
关注
原创 最新推荐文章于 2026-10-29 08:30:00 发布 6.5k 阅读 AI 写同款· GEO 优化 ›
Visual Attribute Transfer through Deep Image Analogy论文阅读笔记 Visual Attribute Transfer through Deep Image Analogy论文阅读笔记 neural style transfer 阅读详情
G-BLASTN的github地址  https://github.com/OpenHero/gblastn  sourceforge地址 http://sourceforge.net/projects/gblastn/  主页： http://www.comp.hkbu.edu.hk/~chxw/software/G-BLASTN.html 两年没日没夜的工作，终于收到回报了， K. Zhao and X.-W. Chu, “G-BLASTN: Accelerating Nucleotide Alignment by Graphics Processors,” Oxford Bioinformatics, 2014   论文地址：[G-BLASTN]  http://bioinformatics.oxfordjournals.org/content/early/2014/01/24/bioinformatics.btu047.abstract?keytype=ref&ijkey=FkuzgmzzPTJss9c
收录于
CUDA

当前文章被收录于：

CUDA
83 篇文章 5 人学习
订阅专栏 查看详情
异构计算

当前文章被收录于：

异构计算
15 篇文章 0 人学习
订阅专栏 查看详情
生物信息学

当前文章被收录于：

生物信息学
10 篇文章 2 人学习
订阅专栏 查看详情
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
KDD2017最佳论文&最佳学生论文奖：Accelerating Innovation Through Analogy Mining 大型概念资源库（如美国专利数据库）可以向人们提供类似问题的解决方案的灵感，从而加速创新和发现。然而在这些庞大而凌乱的资源库中发现有用的信息，对于人类或自动化技术来说仍是一个挑战。传统的解决方法有，具有高度关系结构（如谓词演算表征）但非常稀疏，且成本很高的人工创建的数据库。更为简单的机器学习/信息检索相似性度量可以扩展到大型的自然语言数据集，但很难解释结构相似性，而这又是类比的核心。这篇论文探讨了学习更简单的结构表征的可行性和价值，特别是“问题模式”，它规定了产品的目的，以及实现该目的的机制。论文中的方法结合众包和CNN，提取产品描述中的目的和机制向量表示。论文表明，这些学习到的向量能比传统的信息检索方法，以更高精度和更快速度找到类比。在一个思想实验中，模型检索的类比能力提升了产生创意的可能性。研究结果表明，学习和利用较弱的结构表征，是大规模计算类比的有效方法。 立即下载

相关推荐

Deep Visual Analogy-Making.pdf

Deep Visual Analogy-Making.pdf

BLAST 本地安装后运行blastn command not found: blastn

解决方法： export PATH=/usr/local/ncbi/blast/bin:$PATH

focus627的博客 2808

Visual Attribute Transfer through Deep Image Analogy（个人阅读与注释）

这是论文Visual Attribute Transfer through Deep Image Analogy的原文，内含有小编本人的理解与注释，谨以此分享个人经验和向广大大牛请教，如有错误，请不吝指出，万分感谢！

Innovation Happens Elsewhere? - Ron Goldman有关开源模式的访谈

JavaLobby最近的一个议题是java.sun.com对Ron Goldman关于开源复杂性的访谈，里面有些很有趣的想法:* The key to successful open source projects is passionately shared goals. * There are always more smart people outside of a company than...

技术代码资料库 161

Java后端中的链路追踪：使用OpenTelemetry实现全链路监控

在现代的微服务架构中，链路追踪是监控和优化系统性能的关键技术。通过链路追踪，我们可以跟踪请求在系统中的流转，识别性能瓶颈，定位问题根源。本文将介绍如何在Java后端应用中使用OpenTelemetry实现全链路监控，包括具体的实现步骤和代码示例。通过集成OpenTelemetry，您可以实现全面的链路追踪，帮助您识别瓶颈和潜在问题，从而提升系统的可靠性和用户体验。OpenTelemetry是一个开源项目，旨在提供统一的工具集来收集、处理和导出应用程序的遥测数据，包括跟踪、度量和日志。

聚娃科技开发者博客 1727

代码审计工具学习之RISP（安装以及初步操作）

1 代码审计 1.1名词解释 代码审计（Code audit）是一种以发现程序错误，安全漏洞和违反程序规范为目标的源代码分析。软件代码审计是对编程项目中源代码的全面分析，旨在发现错误，安全漏洞或违反编程约定。 它是防御性编程范例的一个组成部分，它试图在软件发布之前减少错误。 C和C ++源代码是最常见的审计代码，因为许多高级语言（如Python）具有较少的潜在易受攻击的功能（例如，不检查边界的函数）。 顾名思义就是检查源代码中的安全缺陷，检查程序源代码是否存在安全隐患，或者有编码不规范的地方，通过..

weixin_52515588的博客 1万+

二代测序linux软件,二代测序数据分析软件包大全

二代测序数据分析软件包大全Integrated solutions*CLCbioGenomics Workbench-denovoandreference assembly of Sanger, Roche FLX, Illumina, Helicos, andSOLiD data. Commercial next-gen-seq software that extends theCLCbio ...

weixin_36431035的博客 1200

matlab物元可拓模型程序,熵权可拓物元模型

1 概述物元分析方法是中国学者蔡文于20世纪80年代提出的用于解决矛盾问题的技术方法,是研究物元及其变化规律,解决现实世界中不相容问题的有效方法,可应用于生态环境,水资源承载力,农用地分级和土地生态水平等综合评价研究中.本文主要介绍了熵权可拓物元模型的相关概念与该模型的建立过程.2 概念2.1 物元物元分析法的主要思想是把事物用"事物,特征,量值"(分别用N,C,V表示)3个要素以有序三元组的形式...

weixin_33823399的博客 4114

snapgene怎么比对序列_多重序列比对(MSA)分析工具怎么选，看这一篇就够了

多序列比对(multiple sequences alignment，MSA)是开展进化生物学研究的前提，后续可以进行选择压力分析以及推断物种系统发育历史。多序列比对表示不同序列中的氨基酸/核苷酸的位点同源性。将序列比对用于进化分析时，处于相同位置的氨基酸/核苷酸位点则被认为在进化上是同源的，并且具有共同的祖先。通过研究序列比对中同源序列是如何随时间变化的，可以推断序列的结构和功能是如何...

weixin_39768247的博客 5357

基于Ansys Fluent 的颗粒分离/过滤解决方案

过滤是指通过特殊装置将颗粒移除，将流体提纯净化的过程。过滤的方式很多，应用的物系也很广泛，固-液、固-气、大颗粒-小颗粒等。

sh_djoin的博客 1852

电子结构设计（EMD）十年知识总结

客官，你的面相是做结构设计的奇才~1. 材料选择【一出手的0.1s就败了】2. 钣金件设计【折来折去有啥难】3. 塑胶件设计【看着好复杂】4. 型材件设计【凭啥不让我设计】5. 电子结构（PCBA）设计【静电肿么要我背锅】6. 包装设计【要的就是金玉其外，败絮其中】7. 外观（工业）设计【好不好看，谁说了算】8. 标签设计【】9. 标准件选择【一个螺丝难倒英雄汉/提起螺丝，英雄气短】10. 计算仿...

wfeng86的博客 1569

blastn 输出结果每列啥意思_NCBI在线BLAST用法详解

首先进行Blast类型的选择：blastp:将待查询的蛋白质序列及其互补序列一起对蛋白质序列数据库进行查询；blastn:将待查询的核酸序列及其互补序列一起对核酸序列数据库进行查询；blastx:先将待查询的核酸序列按六种可读框架(逐个向前三个碱基和逐个向后三个碱基读码)翻译成蛋白质序列，然后将翻译结果对蛋白质序列数据库进行查询；tblastn:先将核酸序列数据库中的核酸序列按六种可读框架翻译成蛋...

weixin_35370032的博客 4089

虚幻商城 Quixel 免费资产一键入库

在免费领取所有Megascans之后，我们只是有了获取 Quixel Megascans 资产的资格，但是没有入 Fab 库，本文将讲解通过脚本将 Quixel 所有资产入库 Fab。

一碗清深的博客 3339

目前支持CUDA的nVIDIA的显卡型号 驱动及其 修改过后的 inf文件

下载169.21_forceware_winxp_32bit_english_whql.exe NVIDIA Driver for Microsoft Windows XP with CUDA Support (169.21) 我们在运行它的时候，有的就会提示显卡不支持，例如：lenovo T61上的显卡NVS 140m应该是可以支持CUDA的，但是安装驱动的时候，就会提示不匹配。这里我们

OpenHero 开勇 2万+

华为OD新系统机试真题 4.26 -最大化游戏试玩资格分发

华为OD机试新系统真题【最大化游戏试玩资格分发】，提供C语言、Java、C++、Python、Go、JavaScript源码实现，并提供完整思路讲解，以及在线OJ模拟做题。华为OD新系统机试 4月26号真题【最大化游戏试玩资格分发】。

qq_45776114的博客 827

LPDDR5 物理层一致性测试（连载・下）：电平、过冲下冲与 Rx 接收眼图 Mask 掩模完整指标解读

本文系统梳理LPDDR5物理层一致性测试全流程，涵盖差分/单端电平、边沿斜率、交叉点电压、过冲下冲及CS/CA/DQ接收眼图掩模（Rx Mask）测试，详解各参数定义与工程实操要点。强调配置需与DRAM MR寄存器同步，突出差分≠合格、面积积分不可忽视、掩模失败优先排查参考电压与信号完整性等高频坑点，为硬件调试与SI工程师提供权威参考。

一只豌豆象的博客 48

CUDA 线程执行模型分析（一）招兵------ GPU的革命

  CUDA 线程执行模型分析（一）招兵------ GPU的革命 序：或许看到下面的内容的时候，你会觉得和传统的讲解线程，和一些讲解计算机的书的内容不是很相同。我倒觉得有关计算机，编程这些方面的内容，并不都是深奥难懂的，再深奥难懂的事情，其实本质上也是很简单的。一直以为计算机编程就像小时候搭建积木一样，只要知道游戏规则，怎么玩就看你自己了。或许是从小学那会，就喜欢在做数学题的时候用一

OpenHero 开勇 2万+

Statistics and Machine Learning Toolbox

Statistics and Machine Learning Toolbox（带书签），MATLAB统计学习工具

快速开发 CUDA windows 程序

<!--google_ad_client = "pub-8565472114859759";/* 728x90, 创建于 08-7-7 */google_ad_slot = "6330638559";google_ad_width = 728;google_ad_height = 90;//--> <script type="text/javascript"src=

OpenHero 开勇 1万+

VC中sqlite的使用

在VC中对sqlite的使用，实现数据库大批数据的快速插入，读取数据库中的数据在ListCtrl中显示

OV9734 DATASHEET，完整规格书

OV9734完整规格书，包括电气参数，尺寸规格，寄存器配置表等

CUDA windows 开发

1.CUDA toolkit 和sdk·CUDA Toolkit version 1.1 for Win XP ·CUDA SDK version 1.1 for Win XPps: ·NVIDIA Driver for Microsoft Windows XP with CUDA Support (169.21) 在开发的时候，这个可以不用安装，如果是有支持CUDA的显卡的时候，安装

OpenHero 开勇 1万+

老版QQ原生表情gif动态

这是老版的QQ表情，不过全是动态的的，Windows照片查看器是不会动的，可以右击用浏览器打开查看，再说一遍是老版的，只是分享给宁愿用老版也要动态的人。

《GPU的革命》文章整理

整理几年前写的文章，或许对初学CUDA编程的朋友有帮助：CUDA 线程执行模型分析（一）招兵------ GPU的革命CUDA 线程执行模型分析（二）大军未动粮草先行------GPU的革命CUDA硬件实现分析（一）------安营扎寨-----GPU的革命CUDA硬件实现分析（二）------规行矩步------GPU的革命CUDA编程接口（一）------一十八般武器------GPU的革命C

OpenHero 开勇 1万+

9. CUDA shared memory使用------GPU的革命

9. CUDA shared memory使用------GPU的革命 序言：明年就毕业了，下半年就要为以后的生活做打算。这半年，或许就是一个抉择的时候，又是到了一个要做选择的时候。或许是自己的危机意识比较强，一直都觉得自己做得不够好，还需要积累和学习。或许是知足常乐吧，从小山沟，能到香港，一步一步，自己都比较满足，只是心中一直抱着一个理想，坚持做一件事情，坚持想做点事情，踏踏实实，曾经失败过，

OpenHero 开勇 1万+

CUDA VS2005 Wizard

经过两天的开发，终于写好了CUDA 在VS2005上的project 生成向导。两天前还不知道怎么生成VS2005的生成向导，昨天晚上的时候想放弃～想想，既然弄到一半了，就坚持下来了～1.创建Custom Wizard 然后添加自己的内容。里面涉及html编程、js编程、VC custom rule、default.vsproj，vsdir，vsz，ico制作（>_差一点就晕了，还好坚持下来，其实

OpenHero 开勇 1万+

CUDA编程接口（一）------一十八般武器------GPU的革命

  CUDA编程接口（一）------一十八般武器------GPU的革命序言：所谓一十八般武器，不同的年代又有不同的说法，最早的汉武年间的：矛、镗、刀、戈、槊、鞭、锏、剑、锤、抓、戟、弓、钺、斧、牌、棍、枪、叉。到三国的：九长：刀、矛、戟、槊、镗、钺、棍、枪、叉；九短：斧、戈、牌、箭、鞭、剑、锏、锤、抓。再到明清的：弓、弩、枪、刀、剑、矛、盾、斧、钺、戟、黄、锏、挝、殳（棍）、叉、耙

OpenHero 开勇 1万+

Visual Assist 添加支持*.cu文件

 Visual Assist 添加支持*.cu文件1.       打开注册表，在HKEY_LOCAL_MACHINE/SOFTWARE/Microsoft/VisualStudio/8.0/Languages/File Extensions/ 下面添加子键 .cu 然后copy .cpp的键值到.cu。这样才能表示cu也是VS下的VC的工程文件。2.       打开注册表HKE

OpenHero 开勇 1万+

并行计算中的粒度

并发和并行：今天和师妹讨论问题，师妹说到了现在要做的一个项目。要做大规模的并行模拟事件的模拟。问我是否可以在GPU上实现。我们这里拿一群人来分一盒饼干来做例子。一群人要怎么来分这些饼干啦？这里有M个饼干，有N个人要分这个饼干。并发，就是每一个哪一个小饼干，然后各自吃各自的饼干，然后每一轮N个人就分掉了N个饼干。当然这里假设M比N大。并行，就是N个人同时先把一个饼干分了，吃完以后再接着分下面的M-1

OpenHero 开勇 1万+
上一篇： 《大规模并行处理器编程实战(第2版)》今年翻译的一本书出版
下一篇： Windows下搭建deepnet环境
点赞 2
评论 0
书签 书签 1
OpenHero
OpenHero
博客等级 码龄23年 2276粉丝 226原创
+ 关注 专栏目录 订阅专栏
评论
成就一亿技术人!
拼手气红包6.0元
还能输入1000个字符
 
表情包 插入表情
表情包 代码片
 条评论被折叠 查看
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值