webpack.config.js是通用的webpack配置文件，适用于包括Vue和React在内的项目。vue.config.js则是Vue项目的特定配置，提供了一些简化配置的选项。vue-cli3不会自动创建vue.config.js，但在需要自定义配置时可以手动创建。虽然vue-cli3内部集成了webpack，一般用户无需直接操作webpack，但仍可通过vue.config.js修改默认配置。
webpack.config.js是webpack的配置文件，所有使用webpack作为打包工具的项目都可以使用，vue的项目可以使用，react的项目也可以使用。
vue.config.js是vue项目的配置文件，专用于vue项目。通过vue.config.js中常用功能的配置，简化了配置工作，当然如果需要更专业的配置工作，两者在vue项目中是可以并存的。
vue-cli3创建的时候并不会自动创建vue.config.js,因为这个是可选项，所以一般都是修改webpack的时候才会自己创建一个vue.config.js
再然后因为vue-cli3内部高度集成了webpack，一般来说使用者不需要再去webpack做了什么，所以没有暴露webpack的配置文件，但你依然可以创建vue.config.js去修改默认的webpack。
转载：webpack.config.js和vue.config.js的区别_糖糖糖悦吖�的博客-优快云博客_webpack.config.js与vue.config.js
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