方法来源:https://forum.hdfgroup.org/t/hdf5-deleting-datasets-and-recovering-space/1293
h5 数据库,在删除一些数据,表,数组后,无法变小;
或是在多次读写后,会越来越大,并且有一些空间会永久无法重用,导致浪费。
此时可以使用 h5repack 工具,快速重建 h5 数据库,可以立刻把未使用空间省出来。
也可以同时使用无损压缩,进一步减少 h5数据库的空间占用。
重建 h5 数据库的命令
h5repack old.hdf5 new.hdf5
重建 h5 数据库时,同时使用 gzip 进行压缩
h5repack -f GZIP=1 .\tmp_db.hdf5 new.hdf5
h5repack 命令的来源
在hdf5 的官方下载页面 https://portal.hdfgroup.org/downloads/index.html 点击这个

在这里找到预构建的安装程序

我的是windows系统,所以选中 windows 系统

然后选择这个
直接安装之后,重启系统,即可有 h5repack 命令
本文介绍了如何处理H5数据库中删除数据后空间无法释放的问题,推荐使用h5repack工具进行重建,并结合无损压缩(如gzip)以节省空间。详细讲解了Windows系统下的h5repack命令安装和使用方法。

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