2021-10-05

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本文详细介绍了如何在CentOS 7环境下安装VMD软件，并以碳纳米管为例，展示了如何创建、调整结构并导出.pdb文件的操作步骤。

CentOS 7下VMD的安装及.pdb文件的导出

  1. VMD的安装
tar xzvf vmd-1.9.4a51.tar.gz
cd vmd-1.9.4a51
./configure
cd src
make install
  1. 碳纳米管为例导出.pdb文件
    2.1 创建碳纳米管
    在这里插入图片描述
    2.2 调整碳纳米管，排列方式，直径与长度
    在这里插入图片描述
    2.3 在VMD main界面，右键点击显示的文件，选择save Coordinates…
    在这里插入图片描述
    根据需要选择Selected atoms和File type，然后Save…即可。
    在这里插入图片描述
    Make a Little Progress Every Day！
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