此前我们完成了若干篇关于组学孟德尔的挑战,这一次挑战想最近有个有关微量元色话题的孟德尔文章,有想学习的师弟师妹跟我们一起完成这波挑战吧~
Day1
任务=收集信息+明确选题+明确目标期刊+精读范文
第1天:收集信息。
检索关键词:“(trace elements) AND (mendelian randomization)”,这个选题灵感来自最近的一堆公众号推文,经常阅读公众号推文可以有很多关于选题的灵感,也可以学习一些大佬的思路和创新点,鼓励师弟师妹闲暇时间可以多看看一些推文公众号,也是一种快速阅读文献的方法。
明确选题:我自己对微量元素和肥胖这个主题比较有兴趣,所以我拟定的关键词:“((Obesity) AND (trace elements)) AND (mendelian randomization)”。
明确目标期刊:观察了目前孟德尔相关的发文期刊,目标期刊为BMC Medicine(7.0,Q1)或者Frontiers in Nutrition(4.0,Q2)
精读范文:我精选了10余篇近期的孟德尔相关的范文,大概了解了这类型文章的结构组成和准备,进一步准备深入研读,拟定一下接下来几天工作安排和内容。那么我们的挑战就此拉开序幕啦!
Day 2!
Day 2任务=整理所需数据ID+整理所需代码+跑代码
首先,我需要先整理一下微量元素包括哪些,这一步可以通过已发表的文章进行整理,也可以自己进一步进行元素的补充。
其次,我整理好需要的微量元素后,我就在网站检索一下我所需要的微量元素id,将微量元素id进行汇总。
然后用多暴露对单一结局的代码进行循环跑代码,这一步很简单,交给电脑跑就会有结果咯~因为微量元素数量没有组学这么多,所以跑起来很快就结束了。
(PS.这里有个创新的方法,就是我们在选题的时候,可以不着眼于单个结局,可以是多结局等)
之前的挑战也提到了在学术写作中,遵循行业规范是至关重要的。因此,因此STROBE-MR声明对于孟德尔的写作也非常重要。该声明涵盖了六个主要部分:“题目与摘要”(条目1)、“引言”(条目2-3)、“方法”(条目4-9)、“结果”(条目10-13)、“讨论”(条目14-17)以及“其他信息”(条目18-20)。这些条目为我们提供了撰写高质量学术论文的指导和规范。
Day3!
Day3任务=整理数据结果+筛选阳性结果+制作图片
1.整理数据结果:我们微量元素ID分别和结局跑出来了五种方法的OR值,95%CI,P值,异质性,多效性,PRESSO检验,还有四种图片(森林图、散点图、留一法图、漏斗图)
2.筛选阳性结果:筛选方法其实和双样本孟德尔的筛选方法一致,所以用相似的方法去筛选阳性结果即可。
3.制作图片:根据阳性结果,我们可以制作森林图,也可以用所有结果去换环状图,这个可以根据自己对文章的设计进行制作,主打一个直观清晰及美观~
第4天
Day4任务=Method撰写+Result撰写+Introduction撰写写作Method:孟德尔中Method的写作其实和之前挑战的组学孟德尔差不多,因此只需要明确自己暴露和结局的来源,并且明确自己的筛选方法即可。
写作Result:孟德尔中Result的写作其实也是框架式的写作,明确一下你的筛选标准,筛选出来的阳性结果,以及异质性、多效性等结果,其实每一篇文章result部分的展示方法都差不多。
写作Introduction:Introduction这个模块,首先需要分别介绍一下你的暴露和结局,如流行病学、临床表现、目前的困境等,以及暴露和结局之间研究等,当然还需要介绍一下这次主要的方法--孟德尔分析。
今天的挑战整体比较轻松,大家还可以把图片等进行整理一下哦~
第5天
Day5任务=写作Discussion+引文纳入+模块化部分的写作+翻译+润色+选刊
写作Discussion:Discussion的写作方法就是多看看相关暴露和结局文献,如临床研究或者基础研究都可以,都是可以佐证自己观点的证据,当然也可以用上我们教的讨论方法,用上小工具,轻松get讨论。
引文纳入:我的引文是用Endnote20版本进行插入引文,操作简单。
模块化部分的写作:模块化写作包括伦理、致谢、利益冲突声明、作者贡献、基金课题等,可以看一下自己拟投期刊的已发表文章,可以去模仿一下这几块的写作。
翻译:文章中文可以先用我们教的方法翻译为英语。
润色:文章已经是英文版本了,但是语言方面可能需要进一步润色,可以通过我们的润色指令进一步修饰一下语句。
选刊:选刊的方法有好几种,大家可以综合对比起来进行投稿。
以上步骤就是一篇微量元素孟德尔分析的基础流程啦!大家可以对照着我这几天分享的研究思路去完成自己的论文哦!相信只要按照这个流程来操作,一定能够顺利完成一篇高质量的孟德尔分析论文!