生信技能44 - 西湖(中国)生物样本库汉人数据下载和等位基因频率过滤VCF

于 2024-04-19 11:41:57 发布
阅读量489 收藏
点赞数
CC 4.0 BY-SA版权
分类专栏： 生信分析项目实战技能合集 文章标签： 数据分析 数据挖掘 linux
版权声明：本文为博主原创文章，遵循 CC 4.0 BY-SA 版权协议，转载请附上原文出处链接和本声明。
本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/LittleComputerRobot/article/details/137957966
本文介绍了西湖(中国)生物样本库(WBBC)，提供了汉人的基因数据批量下载，并详细解析了VCF文件中的关键信息，如等位基因频率。通过Python脚本`filter_frequency.py`，提取了等位基因频率在0.49-0.51之间的VCF信息。

Westlake BioBank for Chinese (WBBC) 西湖(中国)生物样本库

WBBC，施一公当校长的西湖大学，共纳入~15000个样本，目前提供了hg19和hg38两个版本的数据下载。

WBBC网址：https://wbbc.westlake.edu.cn/downloads.html

1. 可用数据（汉人）

在这里插入图片描述

WBBC网站

2. 批量下载数据（hg38/hg19）

后台下载
nohup sh download_WBBC.sh > download.log 2&>1 &

# download_WBBC.sh
了解本专栏 订阅专栏 解锁全文 超级会员免费看
评论
成就一亿技术人!
拼手气红包6.0元
还能输入1000个字符
 
红包 添加红包
表情包 插入表情
表情包 代码片
 条评论被折叠 查看
添加红包

请填写红包祝福语或标题

个

红包个数最小为10个

元

红包金额最低5元

当前余额3.43元 前往充值 >
需支付：10.00元
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包

打赏作者

生信与基因组学

每一份鼓励是我坚持下去动力

¥1 ¥2 ¥4 ¥6 ¥10 ¥20
扫码支付：¥1
获取中
扫码支付

您的余额不足，请更换扫码支付或充值

打赏作者

实付元
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明：

1.余额是钱包充值的虚拟货币，按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载，可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值