安装包报错1(Warning in install.packages : package ‘phangorn’ is not available (for R version 4.0.2))

当使用R的install.packages()函数安装包遇到'package XXX is not available for R version YYY'的错误时,可以尝试手动下载安装。步骤包括访问CRAN镜像网站,选择对应R版本,搜索目标包并下载,然后在RStudio中通过Package Archive File安装。此方法适用于CRAN上找不到的或特定R版本不支持的包。

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本文引用自Rstudio手动安装程序包

一直以来我们习惯于用install.packages()CRNA中的安装包有的时候我们发现有的时候会报错例如下面这个样子

在这里插入图片描述


> install.packages("phangorn")
Warning in install.packages :
  package ‘phangorn’ is not available (for R version 4.0.2)

我查找了镜像没有问题,但这个包是不是生信的不知道,百度没有,是不是需要Github上去找,我也不知道,我的第一个排查应该相当到CRNA中查找是否存在,可否手动下载。

1、下载对应的R包

打开https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/

2、选择“Download R for Windows”

在这里插入图片描述

3、选择”contrib”

在这里插入图片描述

4、选择对应的R版本

在这里插入图片描述

5、使用快捷键ctrl+F,查找目标R包,并点击下载

在这里插入图片描述

6、 安装下载的R包. 在R studio下,选择packages

在这里插入图片描述

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7、Install from栏选择Package Archive File(.zip;.tar.gz)

在这里插入图片描述

8、Package archive栏点击Browser,选择刚才下载的文件

在这里插入图片描述

9、点击安装

在这里插入图片描述

<think>好的,用户遇到了安装R包时出现的警告信息“package 'mr.raps' is not available”,需要解决这个问题。首先,我得回想一下常见的R包安装问题可能的原因。可能的情况包括拼写错误、包不在用户选择的CRAN镜像中、包已被弃用或移至其他仓库,或者需要从GitHub等源安装。 首先,应该让用户确认包名的正确性。比如是否大小写错误,或者是否存在拼写错误。比如“mr.raps”是否应该是“MR.RAPS”或者其他形式。这一步很关键,因为R对包名的大小写敏感。 接下来,如果确认包名正确,但CRAN中没有这个包,那么可能需要检查其他仓库,比如BioConductor或者GitHub。用户可能不知道这个包是否不在CRAN上,所以需要指导他们如何查找。比如使用available.packages()函数来检查CRAN上的可用性,或者直接在浏览器中搜索。 另外,用户可能没有正确设置CRAN镜像,导致无法访问最新的包列表。这时候可能需要建议他们更换镜像源,使用chooseCRANmirror()或者设置repos参数。 如果包确实不在CRAN上,可能需要从GitHub安装。这时候需要检查该包是否有GitHub仓库,通常开发者会提供安装指令,比如使用devtools::install_github()。需要确保用户已经安装了devtools或remotes包。 另外,可能这个包已经被弃用或改名,所以用户需要查找替代方案。或者,该包可能属于某个特定的R版本,需要检查兼容性。比如某些包可能只支持旧版本的R,或者需要特定依赖。 在指导用户时,应该分步骤说明,从最简单的检查开始,逐步深入。同时,提供具体的代码示例,让用户可以复制粘贴操作。比如先尝试install.packages(),然后检查available,再尝试从GitHub安装。 还要注意用户可能遇到的依赖问题,比如安装devtools时可能需要RTools或Xcode等编译工具。需要提醒用户根据他们的操作系统安装这些工具。 最后,建议用户在解决后测试是否成功加载包,并提示如果所有方法都失败,可以联系包维护者或寻求社区帮助。这能确保用户有全面的解决方案路径,避免遗漏可能的解决方法。</think>要解决R中安装包时出现的警告信息`package 'mr.raps' is not available`,可以按照以下步骤排查和修复: --- ### 1. **检查包名拼写和大小写** - R对包名大小写敏感,且必须完全匹配。例如: ```r # 错误示例 install.packages("Mr.Raps") # 错误的大小写或符号 # 正确尝试 install.packages("mr.raps") ``` - 使用`available.packages()`验证包是否存在: ```r if (!"mr.raps" %in% rownames(available.packages())) { print("包不在CRAN仓库中") } ``` --- ### 2. **更换CRAN镜像源** CRAN镜像可能未同步最新包列表,通过以下命令更换镜像: ```r # 交互式选择镜像 chooseCRANmirror() # 或直接指定镜像(如清华源) options(repos = c(CRAN = "https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN/")) install.packages("mr.raps") ``` --- ### 3. **从GitHub或其他仓库安装** 如果包不在CRAN,可能需从GitHub安装。首先安装`remotes`工具: ```r install.packages("remotes") # 尝试GitHub安装(假设作者为`qingyuanzhao`,仓库名为`mr.raps`) remotes::install_github("qingyuanzhao/mr.raps") ``` - 若失败,需确认仓库地址是否正确(通过包文档或GitHub搜索)[^1]。 --- ### 4. **检查依赖和系统环境** - **依赖工具**:某些包需要编译工具(如Windows的Rtools或macOS的Xcode): ```r # 检查是否已安装编译工具 install.packages("devtools") ``` - **R版本兼容性**:包可能需要更高版本的R,可通过`R.version`检查并升级R。 --- ### 5. **手动安装本地文件** 如果包已下载为`.tar.gz`文件: ```r install.packages("path/to/mr.raps.tar.gz", repos = NULL, type = "source") ``` --- ### 6. **联系维护者或社区** - 在[R包文档](https://cran.r-project.org/web/packages/)搜索`mr.raps`确认状态。 - 在[GitHub Issues](https://github.com/issues)或[R社区论坛](https://community.rstudio.com/)寻求帮助。 ---
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