微生物基因组下载神器:ncbi-genome-download在KOS上部署教程

目录

1 概述

2 安装前的准备

3 安装

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1 概述

KeyarchOS是浪潮信息基于OpenAnolis开源操作系统自主研发的一款服务器操作系统，支持x86、ARM等主流架构处理器，性能和稳定性居于行业领先地位。浪潮信息KOS服务器操作系统-服务器操作系统-浪潮信息

ncbi-genome-download能够批量下载NCBI的基因组相关数据，数据源自refseq数据库和genbank数据库，提供了多种文件格式和特定内容的下载。利用ncbi-genome-download能够避免从NCBI网页上查找下载的繁琐操作，在特定场景下使用可以高效获取数据，方便快捷。

2 安装前的准备

版本信息

• 系统版本：KeyarchOS 5.8 SP1
• 软件版本：Python、pip3

支持的架构：x86_64

资源准备：4核8G Kos虚拟机

3 安装

ncbi-genome-download可通过pip3直接安装，

pip3 install ncbi-genome-download

查看ncbi-genome-download版本，

ncbi-genome-download –V

ncbi-genome-download下载测试

ncbi-genome-download bacteria

下载完成后可在当前目录下refseq/bacteria查看数据信息，