20211221 - 可视化RNA二级结构-主要是arc diagram

原创 已于 2023-03-20 21:13:51 修改 · 4.2k 阅读 · 4 ·
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于 2021-12-21 22:34:49 首次发布
本文介绍了RNA二级结构的可视化工具，包括StructureEditor、VARNA及RChie等，并详细记录了安装与使用的步骤，同时对比了不同工具的特点及适用场景。

文章目录


预期的效果图DSSR介绍文档中的图
在这里插入图片描述
实际实现的图
在这里插入图片描述
缺点：base上面的数字看不清楚

Structure Editor

官方网站
https://www.urmc.rochester.edu/rna/
下载链接 （需要科学上网才能打开）
https://rochester.app.box.com/s/lnjtj4t8vvi18y25x4b9qydz2k5vsvhe
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成功 VARNA （基于Java的jar）

  1. 官方下载VARNA 的jar包
    在这里插入图片描述

  2. 安装

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