基于 ImageJ 的 GCaMP 实验视频自动化工作流(三):具体步骤使用说明

引言

本说明旨在指导用户利用 ImageJ 软件实现 GCaMP 实验视频的自动化处理工作流。通过该流程,用户可以高效地分析实验视频中的信号变化,并生成归一化数据文件供后续分析使用。本教程分为多个步骤,从视频文件的选择,到 ROI(感兴趣区域)的框选,再到自动化数据处理和最终的结果整理,为实验研究提供了系统化的指导。

通过这一自动化工作流,能够显著减少手动操作的复杂性,提高数据处理的效率和规范性,为实验数据的可视化和分析提供可靠支持

代码见上篇:基于ImageJ的GCaMP实验视频自动化工作流(二):视频ROI的选择和批量Time Series Analyzer V3处理,并导出可用于作图的csv-优快云博客

〇、打开Image J打开代码

代码拖入ImageJ,点击“Run”。

一、选择文件夹:

选择需要分析的视频文件所在的文件夹。

二、选择 ROI(感兴趣区域)

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