GreatSQL内存消耗异常排查攻略:从系统到应用层面的深入分析
当 GreatSQL 数据库处于高并发高负载时,可能会发现 mysqld
进程的内存消耗远远超出设置的 innodb_buffer_pool_size
时,有时候甚至会高达甚至超过系统内存的90%,遇到这种问题时,心里经常会发慌,担心下一秒内存就会爆了发生 OOM,或者数据库hang死不响应。
本文和大家试着使用 GreatSQL 中的 sys schema
和 performance_schema
进行深入分析,找出内存消耗大户的源头,并尽可能解决问题。
下面是详细的排查方法和步骤。
1. 确认实际内存消耗
1.1 操作系统层面分析
先检查确认 mysqld
进程的内存具体消耗占用情况,做到心里有数,避免真的下一秒就发生 OOM 的问题:
$ free -ht
free -ht
total used free shared buff/cache available
Mem: 30Gi 28Gi 240Mi 33Mi 2.0Gi 1.7Gi
Swap: 0B 0B 0B
Total: 30Gi 28Gi 240Mi
$ ps aux | grep mysqld
mysql 51931 23.0 89.8 32100800 29008060 ? Ssl Nov22 949:41 /data/apps/GreatSQL-8.0.32-26-Linux-glibc2.28-x86_64/bin/mysqld
$ top -p $(pidof mysqld) -n 1
top - 05:36:37 up 4 days, 4:06, 1 user, load average: 5.56, 8.70, 10.87
Tasks: 1 total, 0 running, 1 sleeping, 0 stopped, 0 zombie
%Cpu(s): 8.4 us, 1.7 sy, 0.0 ni, 86.6 id, 3.4 wa, 0.0 hi, 0.0 si, 0.0 st
MiB Mem : 31553.3 total, 265.6 free, 29148.6 used, 2139.2 buff/cache
MiB Swap: 0.0 total, 0.0 free, 0.0 used. 1903.3 avail Mem
PID USER PR NI VIRT RES SHR S %CPU %MEM TIME+ COMMAND
51931 mysql 20 0 30.6g 27.7g 4656 S 80.0 89.8 949:51.99 mysqld
在上述结果中重点关注几个指标:
RES
(Resident Memory):物理内存占用,约 27.7G。VIRT
(Virtual Memory):虚拟地址空间大小,约 30.6G。
看到 mysqld
进程当前内存消耗占比约 90%,还算可控,没到火烧眉毛的境地。
继续使用 pmap
查看 mysqld
进程中的内存分布情况:
$ pmap -x $(pidof mysqld) | sort -k3 -rn | head -n 20
total kB 32100804 29029796 29016940
00007f8a484d8000 5368992 5361664 5361664 rw--- [ anon ]
00007f892533d000 4698892 4691952 4691952 rw--- [ anon ]
00007f87e961e000 4564872 4556784 4556784 rw--- [ anon ]
00007f86adbe0000 4296832 4290544 4290544 rw--- [ anon ]
00007f86298bb000 1023252 1015792 1015792 rw--- [ anon ]
00007f866c350000 979648 979632 979632 rw--- [ anon ]
00007f87b8112000 719800 712688 712688 rw--- [ anon ]
00007f89046d4000 451760 444400 444400 rw--- [ anon ]
0000000005afc000 286800 282640 282640 rw--- [ anon ]
00007f8ba7715000 200300 200276 200276 rw--- [ anon ]
00007f8578000000 131072 131072 131072 rw--- [ anon ]
00007f8570000000 131072 131072 131072 rw--- [ anon ]
00007f8568000000 131072 131072 131072 rw--- [ anon ]
00007f8560000000 131072 131072 131072 rw--- [ anon ]
00007f8558000000 131072 131072 131072 rw--- [ anon ]
00007f8550000000 131048 131048 131048 rw--- [ anon ]
00007f8438000000 130668 130668 130668 rw--- [ anon ]
00007f8b98000000 65536 65536 65536 rw--- [ anon ]
00007f8b94000000 65536 65536 65536 rw--- [ anon ]
看到大量的匿名内存(anon)消耗较多内存,这可能是由以下几个原因引起的:
动态分配的内存:
-
- GreatSQL 在运行过程中会频繁地进行内存分配和释放,这些内存通常是以匿名映射的形式存在于进程的虚拟地址空间中。
- 例如,GreatSQL 的线程池、缓存、临时表等都会动态分配内存。
缓冲区和缓存:
-
- GreatSQL 使用大量的缓冲区和缓存来提高性能,例如InnoDB Buffer Pool(以下简称 IBP)、InnoDB Log Buffer等。
- 这些缓冲区和缓存通常会占用大量的匿名内存。
线程堆栈:
-
- 每个线程都有自己的堆栈空间,这些堆栈空间也是匿名内存的一部分。
- 为了响应用户请求而创建了大量线程,那么这些线程的堆栈空间会占用不少内存。
临时文件:
-
- GreatSQL 在处理大查询或排序操作时,可能会使用临时表、临时文件,其内存映射也会占用匿名内存。
内存泄漏:
-
- 如果 GreatSQL 存在内存泄漏问题,也会导致匿名内存不断增加。
可以针对上述各个模块/维度做进一步排查分析。
1.2 检查 IBP 内存相关配置
- 使用以下 SQL 命令查询 IBP 等内存消耗较多的相关模块内存配置
greatsql> SHOW GLOBAL VARIABLES LIKE 'innodb_buffer_pool_size';
+-------------------------+-------------+
| Variable_name | Value |
+-------------------------+-------------+
| innodb_buffer_pool_size | 21474836480 |
+-------------------------+-------------+
greatsql> SHOW GLOBAL VARIABLES LIKE 'innodb_log_buffer_size';
+------------------------+----------+
| Variable_name | Value |
+------------------------+----------+
| innodb_log_buffer_size | 33554432 |
+------------------------+----------+
从上面可见 IBP 设置为 20G,但是 mysqld
进程的内存占用为 27.7G,超过 IBP 较多,这可能是由于用户的 SQL 请求(比如效率较低的慢查询 SQL)其他模块或线程引起。还需要继续排查。
2. 利用 Performance Schema 排查内存消耗来源
从 5.6.6 版本开始,Performance Schema 默认启用,是一个内置的性能诊断工具,用于实时监控和分析 GreatSQL 服务器的运行状态。它提供了详细的性能数据,包括 内存分配的全局视图、SQL 语句的执行时间、线程活动、锁等待等详细信息,帮助开发者和 DBA 识别和解决性能瓶颈。
2.1 按内存模块查看占用
使用 memory_summary_global_by_event_name
按模块查看内存分配情况:
greatsql> USE performance_schema;
greatsql> SELECT
EVENT_NAME,
CURRENT_NUMBER_OF_BYTES_USED AS memory_bytes,
CURRENT_NUMBER_OF_BYTES_USED / 1024 / 1024 AS memory_mb
FROM
performance_schema.memory_summary_global_by_event_name
WHERE
CURRENT_NUMBER_OF_BYTES_USED > 0
ORDER BY
CURRENT_NUMBER_OF_BYTES_USED DESC
LIMIT 10;
+--------------------------------------------------------------------+--------------+----------------+
| EVENT_NAME | memory_bytes | memory_mb |
+--------------------------------------------------------------------+--------------+----------------+
| memory/innodb/buf_buf_pool | 21957836800 | 20940.62500000 |
| memory/group_rpl/GCS_XCom::xcom_cache | 1070853221 | 1021.24521351 |
| memory/mysys/IO_CACHE | 84149952 | 80.25164795 |
| memory/performance_schema/events_statements_summary_by_digest | 42240000 | 40.28320313 |
| memory/innodb/log_buffer_memory | 33555440 | 32.00096130 |
| memory/innodb/ut0link_buf | 25165888 | 24.00006104 |
| memory/innodb/lock0lock | 22440096 | 21.40054321 |
| memory/sql/TABLE | 15646883 | 14.92203045 |
| memory/performance_schema/events_statements_history_long | 15040000 | 14.34326172 |
| memory/performance_schema/events_errors_summary_by_thread_by_error | 14561280 | 13.88671875 |
+--------------------------------------------------------------------+--------------+----------------+
10 rows in set (0.00 sec)
EVENT_NAME
:具体内存分配的模块名称,如memory/innodb/buffer_pool
、memory/sql/temporary_table
等。CURRENT_NUMBER_OF_BYTES_USED
:当前分配的内存总量。
例如:
如果
memory/innodb/buf_buf_pool
值较高,说明 InnoDB buffer pool 占用较高。其他几个包含memory/innodb
关键字的,也都是和 InnoDB 存储引擎相关的内存模块。其中
memory/mysys/MY_BITMAP::bitmap
主要用于管理位图数据结构 (bitmap) 的内存使用。它的设计初衷是为了实现高效的位存储与处理,主要用于存储和操作需要标志位(bit flag)来跟踪或控制的数据。其具体存储的数据包括但不限于:-
- 索引或表分区的状态:位图被用来记录索引或分区的使用状态。例如,在分区表扫描时,通过位图可以高效管理哪些分区需要扫描或已经扫描。
- 事务或锁状态:记录事务的特定标志位或锁的使用状态,比如资源锁(resource locks)的分配状态。
- InnoDB 的内部操作:位图被用于跟踪一些内部存储引擎的优化过程,例如自适应哈希索引、页的脏位(dirty bit)标记等。
- 线程管理:管理线程池中线程的分配和使用状态。
- 性能统计:在某些性能分析的场景下,位图用于记录启用或禁用的统计模块。
其中
memory/group_rpl/GCS_XCom::xcom_cache
是 MGR Xcom cache,在 GreatSQL 8.0.32-26 中初始默认值即为 1GB,详情参考 Xcom cache分配静态化。其他几个包含group_rpl
关键字特征的,也是和 MGR 相关的模块。其中
memory/mysys/IO_CACHE
是一个重要的内存管理模块,主要用于管理和优化文件I/O操作。IO_CACHE 提供了一个高效的缓存机制,可以显著提高文件读写操作的性能。主要存储的数据有:-
- 临时文件数据:排序、分组、联接等操作过程中生成的中间结果。
- 二进制日志:binlog 的写入和读取操作中使用缓存。
- 文件块:GreatSQL 访问文件时,将数据块加载到缓存中,避免重复读取。
- 表数据:表扫描或索引扫描时,用于缓存表或索引的数据。
如果
memory/sql/temporary_table
值较高,说明内存被临时表消耗。如果
memory/innodb/hash_index
值较高,可能是 InnoDB 的自适应哈希索引占用内存。
上面的查询结果表明,memory/innodb/buf_buf_pool
(IBP) 占用内存约 20G,memory/group_rpl/GCS_XCom::xcom_cache
(MGR XCom Cache) 占用内存约 1G,都是符合预期的。但是 memory/mysys/IO_CACHE
占用的内存较高,需要重点排查。
2.2 跟踪各模块内存使用变化
可以每间隔一段时间重复执行下面的 SQL 请求,观察各个模块的内存消耗变化,找出内存消耗增长较快的模块,它们可能就是导致 mysqld
进程消耗较大内存的“元凶”。
greatsql> USE performance_schema;
greatsql> SELECT
EVENT_NAME,
SUM(SUM_NUMBER_OF_BYTES_ALLOC) / 1024 /