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原创 特定脑区的可视化展示

overlay #展示脑区 #高亮指定脑区 #脑区展示:利用matlab、DPABI、mricron等工具展示选定脑区。

原创 python的.py文件封装为exe

使用的是jupyter notebook，想要把python程序封装成win系统下的.exe可执行文件。

原创 查找期刊杂志的简称

期刊简称 #杂志简称。

原创 GRETNA分析图论指标卡住一直显示显示箭头符号( ＞＞＞)解决办法

利用gretna工具包分析医学影像的图论指标时，输入脑影像载入指标开始分析的时候，显示一直在运行中，一直出现很多点，持续显示箭头符号。这个queue相当于时batch_size，即同时处理的例数，可以根据电脑的配置决定，太多的话会报错，填少的话会增加计算时间。比如跑96例可以填4，也可以填16,32，但是不能填7，不然除不尽，跑到最后一组的时候就会一直卡在那里。GRETNA的Queue需要设置成被试数目的因数，不然会卡在那里。一直显示显示箭头符号 >>>

原创 读取dicom图像以及头文件

【代码】读取dicom图像以及头文件。

原创 AAL脑模板各个脑区的解剖分类和功能分类

AAL脑模板即自动解剖标记图谱，常用于神经影像研究。

原创 AAL3脑图谱（自动解剖标记图谱第三版）各个脑区中英文对照及脑区坐标

相关链接：AAL图谱各个脑区坐标AAL脑图谱中文名称及英文全称AAL脑模板各个脑区的解剖分类和功能分类

原创 AAL脑图谱中文名称及英文全称

AAL脑图谱（Anatomical Automatic Labeling），被广泛用于神经成像研究。

原创 AAL图谱各个脑区坐标

MNI坐标 #蒙特利尔神经所大脑分区坐标。：#AAL脑区 #脑模板对应坐标。

原创 深度学习中针对样本不均衡问题的解决办法

会导致模型忽视少数类别的样本，从而影响模型的泛化能力。

原创 python向下取整与取整

输出结果向下取整，比如1.2取1, 0.63取0， 注意-1.3取-2.：利用math模块中的。

原创 Linux批量重命名文件夹

的形式进行重新命名。如sub1,sub2,…有一批文件夹命名格式不一致，需要按照。进入Linux命令行。

原创 Linux批量修改文件夹名称

有一批文件夹需要去除文件夹命名下的下划线。比如文件夹名为sub_901.

原创 影像分割公开数据集

数据集：ISBI Neuronal Structure Segmentation Challenge。（包含7个专家的手动勾画，图像大小为144。脑部影像分割数据（T1,T2两种影像）MICCAI MR脑分割挑战。婴儿MRI不同模态数据集。

原创 脑区展示网页资源

在线展示脑区brainvoyagerbraintutor。

原创 PubMed检索方法与技巧

PubMed属于NIH，是一款学术搜索引擎，主要内容为医学数据库。

原创 Python学习资源

原创 MRIcron去除颅骨

输入参数(0.2,.0.5…参数越大,剥的越彻底)

原创 基于cat12的VBM分析

TIV(Estimate TIV) 选择report文件夹里的.xml文件。:解压后复制cat文件夹到spm\toolbox下即可。:Segment(分割灰质,白质和脑脊液)打开cat12 (在tool选项中):平滑(Smooth)文件夹里,评估结果在。

原创 利用wfu pickatlas保存脑区ROI

将WFU压缩包剪切到matlab的SPM-toolbox中，然后在matlab的设置路径中添加子文件夹（add subfolder）为WFU的文件夹。如有需要可重新添加一次SPM文件夹（这次可添加整个文件夹即add folder），因为刚刚spm下文件夹的内容发生了变化。最后在matlab的命令界面输入wfu_pickatlas即可打开WFU主界面。在中间位置即可看到相应脑区mask(红色区域)选择AAL分区,再选择相应脑区(可多选)按钮即可保存为nii格式的mask。保存为mask:点击下方。

原创 批量移动文件夹下的nii文件到指定文件夹

批量复制或移动文件夹及子文件夹下的nii文件到另一个文件夹。#linux #bash #复制文件夹下的nii文件。TARGET_DIR= 目标文件夹。SOURCE_DIR= 原文件夹。

原创 linux批量新建同名文件夹

已知一批包含文件的文件夹，想要重新新建一批同名的空文件夹。

原创 功能连接分析时，设置种子点ROI半径多大合适

1] 沈巍.MRI静息态脑功能成像对颈型颈椎病针刺后镇痛效应的研究[J].针灸临床杂志,2021,37(08):10-15.[3] 王智等，基于静息态功能磁共振成像初探调息联合经皮耳穴迷走神经刺激的协同效应。[2] 朱瑞等,2型糖尿病相关执行功能网络改变特征——静息态功能磁共振研究。[4] 陈君等，网络游戏成瘾患者脑功能异常静息态功能磁共振成像研究。[6] 李珈含等，不同动机特质在静息态下脑功能的相关研究。

原创 dti数据转换出来没有大小和方向文件

使用mricron对DTI数据进行转换，使用dcm2niigui工具对dicom文件进行转换时，转换后生成的文件没有bvec、bval（大小、方向文件）。

原创 微信阅读批量截屏保存书籍

2.设置的点击坐标不要靠上，不然会点击到图片。5.可将字号设置最小，行间距设置最小。4.设置锁屏时间，不然会黑屏。#自动爬取书籍 #微信读书。3.关闭微信、QQ消息通知。

原创 Zotero引用中文文献

4. 打开zotero,点击左上菜单栏–“Zotero引用知网文献，中文文献。

原创 利用VBA批处理word 文档，使用宏对docx文件内容进行批量替换

===================== 下面的宏换成你自己的宏=================================：有一系列的word文档，想把每份文档里面的名字A换成名字B。：VBA 批处理 word ,使用宏批量替换内容。word 宏操作 批处理文档。

原创 解除网页复制限制，自由编辑网页

浏览器控制台输入document.body.contentEditable=true直接编辑网页。#自由编辑网站内容， 网页元素任意编辑，修改网页内容 ，解除无法复制内容的限制。

原创 SPM只显示FWE不显示FDR校正解决办法

【代码】SPM只显示FWE不显示FDR校正解决办法。

原创 zotero添加参考文献去掉doi号

使用zotero插入参考文献时，默认会附带DOI号。复制代码到txt文档中 替换全部DOI、doi为空。另存为路径选择 zotero文件路径下的。

原创 罗技 Logitech G-HUB打不开一直转圈

可将这几个文件的快捷方式发送至同一文件夹内，方便快捷打开。接下来进入Logitech G-HUB安装目录，一般在。打开任务管理器，然后关闭。

原创 脑影像制作slice切片展示图

保存层数label、colorbar（提前设置colormap)。截取slice粘贴至ppt中，点击。中可以改变层数之间的重叠程度。改变图层位置，设置重叠程度。中可以改变所要展示的层数。选取一个矢状面截图，插入。左侧可以设置加载的层数。即可将背景设置为白色。

原创 影像分析载入T图进行多重校正

选择校正方式 – 输入Mask(可用自带的BrainMask) – 设置单尾/双尾。设置团块大小，最后一栏可以输入默认值。

原创 matlab计算得到AAL脑图谱各个脑区ROI的质心坐标

AAL脑图谱（自动解剖标记图谱）包含116个脑区。利用matlab程序计算各个脑区的质心坐标。

原创 matlab读取nii文件并修改大于1的像素值为1，最后保存导出

matlab读取nii文件并修改大于1的像素值为1，最后保存导出。

原创 windows系统剪切板不弹出，无法使用

打开任务管理器，在任务管理器中找到文件管理器进程，鼠标右键关闭文件管理器进程即可。：Windows键盘的锁Win键功能被触发，windows键被锁定不能使用了。：可能是文件管理器出现冲突。

原创 ppt快速批量调整图片大小一致

一栏调整高度和宽度，图片大小即可批量调整为一致。：快速批量调整图片大小一致，并对齐。

原创 改变nii文件时间点，改变nifti影像第四维时间点个数

更改nii文件的时间点#更改nii文件的时间点 #更改nifti文件时间点 #更改时间点。

原创 dcm转nii，Dicom转Nifti的几种方法

可以转换dicom格式的图像为nifti格式。格式的文件拖入对话框中即可。中，可以同时导出头文件为。文件（可用记事本打开）。pipeline即可。

原创 变换nii图像的左右，将nifti影像左右翻转

#nii_flip #flip_nii #niiflip.m #nii读取nii导出。