单细胞findmarkers鉴定出每个基因的logFC,相应重排序，GSEA是个富集好选择。
参考：
个人觉得无论bulk还是sc，对全gene matrix依据logFC排序再做GSEA是比较合适的，提取出差异基因对markers做GSEA个人感觉是原理上的错误。
【fGSEA】简便GSEA
本文探讨了在单细胞数据分析中使用GSEA进行富集分析的实践，强调了基于logFC排序全基因矩阵进行GSEA的重要性，指出直接用差异基因做GSEA可能存在原理上的误区。
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