多数数据集中有蛋白质序列但不存储蛋白质ID,这使得PDB文件获取困难,如何找到蛋白质序列对应的ID,参考以下(还没有找到批处理方法,如果有知道的小伙伴评论区留言):
2. 高级搜索:
多数数据集有蛋白质序列却无ID,导致PDB文件获取难。本文介绍查找蛋白质序列对应ID的方法,包括进入RCSB PDB官网,进行高级搜索,输入目标序列,筛选(取score最小),可下载相关文件,最后验证结果,判断序列是否一致。
多数数据集中有蛋白质序列但不存储蛋白质ID,这使得PDB文件获取困难,如何找到蛋白质序列对应的ID,参考以下(还没有找到批处理方法,如果有知道的小伙伴评论区留言):
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