设计模式的心法原则之 开闭原则

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设计模式的心法原则之 开闭原则

SYBYL软件和计算机辅助药物设计.pptx
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ok计数器使用教程_药物设计软件Sybyl教程(三):大分子蛋白准备过程
文 / 利刃君微信ID / ziyuanliren666全文共3067字,推荐阅读时间15分钟。教程内容:以SYBYL-X 2.0软件为例,对大分子蛋白受体利用BIOPOLYMER模块进行准备。1视频教程建议在wifi环境下观看~2图文教程1.导入蛋白本教程中所用蛋白晶体结构由PDB数据库(http://www.rcsb.org/)搜索下载。点击File > Import File...
计算化学+分子模拟+分子力场说明文档+TRIPOS,SYBYL
本文档是计算化学分子模拟领域的分子力场说明文档,介绍TRIPOS分子力场,Kollman 分子力场,AMBER分子力场和默克MMFF分子力场。内容包括SYBYL分子力场,原子电荷,能量最小化,分子动力学,扭转能等等物理的能量计算方法以及TRIPOS立场参数生成原理。
SYBYL下载安装和入门使用学习记录
转用Autodock等业界更认可的软件了…
【SPSS操作】Non-parametric ANCOVA (Quade‘s) in SPSS
在SPSS中执行Quade的非参数ANCOVA需要手动计算步骤,因为SPSS没有内置的菜单选项。以下是详细的操作指南。
HBuilderX结合Android Studio实现Uniapp安卓Apk高效离线打包指南
本文提供了一份详细的Uniapp安卓Apk离线打包实战指南。通过整合HBuilderX与Android Studio,手把手教你搭建本地编译环境、配置原生工程、执行核心打包流程,并分享快速更新资源和排查常见问题的技巧,助你彻底摆脱云端打包的排队依赖,实现高效、可控的应用构建。
COMFA tutorial--Sybyl
COMFA tutorial 来源:sybyl说明书 1 打开 :Sybyl-x2.0; 2 点击:“Options”----“Set”----“Default Directory”,设置保存路径; 3 点击:“Flie”----“Import File” 选择需要做COMFA的所有小分子导入Sybyl; 4 点击: “File”----“Database”----“New”,创建数据库,输入数据库名称“XXX.mdb”; 5 点击:“File”----“Database”----“Open”
逆变器母线电容选型与均压电阻设计实战指南
本文为逆变器母线电容选型与均压电阻设计提供了实战指南。文章从工程角度出发,详细解析了母线电容耐压值、容值的计算方法,并重点强调了纹波电流热设计的重要性。同时,深入探讨了串联电容均压电阻的设计原则与功率计算,通过5.5kW变频器案例,系统演示了从参数确定到最终选型的完整流程,旨在帮助工程师设计出稳定可靠的逆变器系统。
Linux下Sybyl的安装
将安装文件SYBYL-X2.0-Linux-x86_64.exe.gz拷到系统/opt目录下(不管是ssh还是光盘挂载此处不介绍)。 下面开始安装: 1、建立安装目录mkdir /opt/tripos 2、解压缩文件 gunzip SYBYL-X2.0-Linux-x86_64.exe.gz 3、赋予安装文件可执行权限chmod a+x SYBYL-X2.0-Linux-x86_64.exe 4、开始安装./SYBYL-X2.0-Linux-x86_64.exe,接下来跳出与Windows下一样的
c# U盘禁用---守护进程(插入,拔出,卸载等操作)
一、简介 传统的对U盘禁用,我们多采用修改注册表的方式,详情参考:https://blog.youkuaiyun.com/qq_25372599/article/details/79815407;本文将介绍一种其他的方式–后台守护程序。其原理非常简单:当守护程序检测到U盘的插入信号,我们自动卸载U盘,致使系统无法识别U盘,达到禁用U盘的效果。 二、程序设计 2.1 变量定义 strin...
YIUI框架深度解析:基于ET的数据驱动UI开发实践
在Unity游戏开发中,UI管理是构建复杂应用的核心挑战之一。传统命令式编程需要开发者手动操作每个UI组件,导致业务逻辑与视图层高度耦合,代码难以维护。数据驱动是一种先进的架构思想,它通过建立数据模型与UI组件之间的绑定关系,实现数据变化时UI的自动更新,从而将开发者的关注点从“如何操作UI”转移到“数据状态是什么”。这种模式显著提升了代码的可维护性和开发效率,尤其适用于状态频繁变化的游戏界面。YIUI框架正是这一思想在Unity UGUI上的工程化实践,它通过Model-View-Component的清晰
【免费下载】 SYBYL-X 2.0:开启3D-QSAR模型构建的新纪元
SYBYL-X 2.0:开启3D-QSAR模型构建的新纪元 【下载地址】SYBYL-X2.0软件基础应用及3D-QSAR模型构建使用说明分享 SYBYL-X 2.0软件基础应用及3D-QSAR模型构建使用说明 项目地址: http...
04 Zabbix自定义触发器
1、触发器是什么 触发器表达式:允许定义一个什么状况的数据是“可接受”的阈值。因此,如果接收的数据超过了可接受的状态,则触发器会被触发 , 或将状态更改为异常。 一个触发器可以拥有下面几种状态: 值 描述 OK 这是一个正常的触发器状态。在旧版本的Zabbix中称为FALSE。 PROBLEM 通常意味着发生了某些事情。例如,处理器的负载较高。在旧版本的Zabbix中称为TRUE。 2、创建触发器TRIGGER 案例:系统超过3个用户登录,则告警。 2.1 开启告警声
用Sybyl对3个天然产物库处理
用Sybyl对3个天然产物库处理 •包括简单的去重复分子和3D构象生成(没有对Bad group进行去除) •1、 Chemdiv 得到8124个分子,重复分子2510个分子 •2、 Zinc得到96991个分子,重复分子70513个分子 •3、 J&K得到84712个分子,重复分子8788个分子 •将3个库合并得到189827个分子,去重后得到144564个分子 由于表单过大,导致SYBYL对接过程中断及无法打开等情况,采取将数据库拆分及其他的方法重新进行操作; 用Sybyl进行二次处理1
RK3568/RK3588 + YT 9215交换机芯片,MAC TO MAC 调试记录
原来的方案是rk3568 gmac 直接接phy,phy 接 switch 芯片,只是把交换芯片当交换用,驱动方面基本不用开发,但是要做vlan 那么必须涉及交换芯片的开发。选择裕太微有两个方面的原因:1.国产化替代2.可获得原厂技术支持3.目前已经完成 两个gmac 口交换芯片的配置,实现vlan,内部交换,两个光口可正常通信。
基于 Qt C++ 的金融行情交易终端
由于完整的商业级源码非常庞大,我将为你提供一个 **结构完整、可直接编译运行的基础框架**,并详细说明各模块的实现思路和扩展方向。double波动 = quote.lastPrice * (rand()%200 - 100) / 10000.0;// 订单缓存(orderId -> Order)
Sybyl分子对接操作流程
Sybyl分子对接操作流程 20160817 win7 1、打开sybyl-x 2.0; 2、点击“applications”----“Docking Suite”----“Dock Ligand”; 3、“Docking Mode”:Surflex-Dock(SFXC); (1)“Filename”栏点击“Define”----“Protein Structure”选择“mol2”右边的“…”打开蛋白分子(如 处理好导入mol2,没处理可选pdb) (2)“Protomol Generation
win10 跳过U8环境检测的IE WebControls.rar
win10 安装u8的时候 提示IE WebControls 不通过,这个工具可以欺骗u8的检查。 跳过U8环境检测的IE WebControls。提示导入失败后,重新检测通过。
CADD课程学习(11)-- 构建已有小分子的构效关系模型(SYBYL)
CADD课程学习(11)-- 构建已有小分子的构效关系模型(SYBYL)
老版QQ原生表情gif动态
这是老版的QQ表情,不过全是动态的的,Windows照片查看器是不会动的,可以右击用浏览器打开查看,再说一遍是老版的,只是分享给宁愿用老版也要动态的人。
霍尼韦尔SoftMaster使用说明
霍尼韦尔SoftMaster使用说明
【免费下载】 SYBYL-X 2.0软件基础应用及3D-QSAR模型构建使用说明
SYBYL-X 2.0软件基础应用及3D-QSAR模型构建使用说明 【下载地址】SYBYL-X2.0软件基础应用及3D-QSAR模型构建使用说明分享 SYBYL-X 2.0软件基础应用及3D-QSAR模型构建使用说明 项目地址: ...
ssm框架搭建
这个是一个在idea上成功跑起来的ssm框架项目,保存在这里方便以后使用直接下载
javplayer 使用教程_药物设计软件Sybyl教程(一):基于Tripos力场对小分子配体进行结构优化...
文 / 利刃君微信ID / ziyuanliren666全文共1104字,推荐阅读时间6分钟。教程内容:以SYBYL-X 2.0软件为例,对小分子配体进行基于Tripos力场的能量最小化计算,优化分子结构,获得合理构象。1视频教程建议在wifi环境下观看~2图文教程1.导入结构点击File > Import File,Files of type选molecule,在Director...
使用SYBYL对接(Docking)后没弹出Results Browse窗口?
解决sybyl进行docking后无法弹出Results Browse的问题
Sybyl动力学模拟操作
Sybyl动力学模拟操作 1、Option----Tailor,Subject选择SOLVENT,可按需修改参数,最后一行增大可减少水分子数量,降低计算量,默认0.8,可设置1.0或者1.2。 2、File-get framment,拉至最后,选择WATER,添加水分子。 3、点击Edit-Solvent,将水分子添加到体系。 4、对加入的水分子进行能量优化(如蛋白配体之前已经平衡好了,可只对水分子MM,若没平衡好,需对整个体系进行能量优化) 5、对体系先进行NVT平衡,然后再进行NPT平衡(需要设置压力
常用分子力学与力场的参考文献
常用分子力学与力场的参考文献Molecular Mechanics and Force Field References--------------------------------------------------------------------------------AMBER, Assisted Model Building and Energy Refinement
基于对虚拟筛选结果挑选的规则----Sybyl
基于对虚拟筛选结果挑选的规则----Sybyl 20161230 win7 根据对接打分Total Score,挑选TS>8.0分的化合物; 基于TS>8.0,从对接得到的构像(默认20个)中挑选Cscore≥4的化合物; 2.1 统计TS>8.0,CS≥4的构型所占的比例,如7/20; 2.2 计算这些构型的平均分; 2.3 统计这些构型在各个分段下的分布,如10-11分3个; 2.4 统计这些构型的RMSD值; 观察并记录这些构型与蛋白之间的相互作用,挑
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