使用pec包的calPlot函数绘制多时间竞争风险生存数据的校准曲线

最新推荐文章于 2024-12-29 09:25:36 发布

程序编码实践

最新推荐文章于 2024-12-29 09:25:36 发布

阅读量299

点赞数 1

CC 4.0 BY-SA版权

文章标签： R语言

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/CoderExtra/article/details/132350162

90 篇文章 ¥59.90 ¥99.00

订阅专栏

本文介绍了如何在R语言中使用pec包的calPlot函数绘制多时间竞争风险生存数据的校准曲线。首先，安装并加载pec包，接着准备包含生存时间和事件信息的数据，然后调用calPlot函数绘制校准曲线。通过比较校准曲线与理想曲线，可以评估生存模型的预测准确性，并据此改进模型。

使用pec包的calPlot函数绘制多时间竞争风险生存数据的校准曲线

在R语言中，我们可以使用pec（Population Event CounTable）包来进行多时间竞争风险生存数据的校准曲线绘制。PEC包是一个用于生存分析和合并数据的强大工具。本文将向您展示如何使用pec包中的calPlot函数绘制校准曲线，并提供相应的源代码实例。

install.packages("pec")

然后，通过以下命令加载pec包：

library(pec)

准备数据
在绘制校准曲线之前，我们需要准备相关的数据。假设我们有一个多时间竞争风险生存数据集，其中包含了多个观察单位的生存时间、事件信息以及竞争事件的发生时间。

下面是一个简单的示例数据集：

# 创建示例数据
data <- data.frame(
  time = c(10, 15, 20, 25, 30),
  event = c(1, 1, 0, 1, 1),
  competing_event_time = c(NA, 18, NA, 27, NA)
)

在这个示例数据集中，time列表示观察单位的生存时间，event列表示观察单位是否发生事件（

了解本专栏