生物信息学_分子数据库（二）核酸

核酸序列数据库主要包括了基因组DNA序列，mRNA序列，tRNA序列，rRNA序列等核酸序列。国家上有三个主要核苷酸序列公共数据库：

• 位于英国剑桥的欧洲分子生物学实验室的欧洲核苷酸档案库（ENA）
• 位于美国的生物技术信息中心的GeneBank数据库
• 位于日本的DNA数据库（DDBJ）

分别收集来自不同地区的数据，三大数据库进行数据共享且向世界开放。

核酸序列数据增长迅速，所以数据库版本更新较快，进行生物信息学分析时，务必注明数据库的数据状况及时间。

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为维持数据的原始性，未经原作者允许，不能对原始数据库中的数据记录进行更新，修改，甚至加上注释，这就是一级数据库。

一级数据库

以Genbank为例：

Genbank

数据组织形式

数据库中数据量巨大且不断增长，为了方便数据的维护管理以及查询，将数据进行分类，分为不同的子数据库（不同的数据库分类依据略有不同）：

• 种属来源

如哺乳类、啮齿类和病毒等

• 特点测序策略

主要依据序列来源分为专利、人工合成、表达序列标签（Expressed Sequence Tags，EST）、高通量