生物信息学_分子数据库(一)分子数据库概述

为什么需要分子数据库?

数据库记录包括两部分:

1.原始序列数据

2.描述原始数据的生物学信息的注释

随着研究的积累,生物信息数据越来越多,且在研究中,如果仅仅知道数据的来源

而对其他方面知之甚少,研究也会变得极为困难。

所以为了研究的便利,能够对数据进行存储共享和使用,所以分子数据库应运而生。


分子数据库

数据库数量多

数据库种类复杂

数据量巨大且不断增长

数据间关系复杂

数据存在冗余和偏差

版本不断更新

提供开源web服务

分子数据库种类繁多,但是主要可以分为三大类:

1.核酸数据库

2.蛋白质数据库

3.其他数据库

在这里插入图片描述

数据存储格式

分子数据库数据库数据量巨大且增长速度快,数据之间关系复杂,为了方便对数据的收集,整理,分析,所以规范了数据的格式。

FASTA格式

1.基于文本形式的数据存储格式,格式中碱基对或氨基酸用单个字母表示。

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