【MIMIC数据库教程】十、使用Python提取所有患者的尿酸指标(下)


【MIMIC数据库教程】十、使用Python提取所有患者的尿酸指标(下)

摘要: 在本专栏第九篇文章中,介绍了从MIMIC-IV数据库的Hosp模块的labevents表中提取所有患者的尿酸指标,这篇文还在那个介绍提取ICU模块的chartevents表中提取所有患者的尿酸指标,本文将介绍如何将两个表中的尿酸指标合并为一个表,并保存为CSV文件。

检索ICU模块中尿酸检查的itemid

ICU模块尿酸检查的详细信息包含在d_items表中,表中itemid字段表示检查项目,label字段表示检查名称,尿酸的标准英文是Uric Acid,我们检索d_items表中label字段包含Uric Acid的itemid, 代码如下:

import pandas as pd

# 读取CSV文件
df = pd.read_csv('d_items.csv')
# 检索label中包含'Uric Acid'的行
filtered_df = df[df['label'].str.contains('Uric Acid', case=False, na=False)]
# 将DataFrame转换为Markdown表格
markdown_output = filtered_df.to_markdown(index=False)
# 显示Markdown格式的输出
print(markdown_output)

检索结果如下,尿酸是血液检查,因此确定itemid为221032。

itemid label abbreviation linksto category unitname param_type lownormalvalue highnormalvalue
221032 Lauric acid Lauric
评论
添加红包

请填写红包祝福语或标题

红包个数最小为10个

红包金额最低5元

当前余额3.43前往充值 >
需支付:10.00
成就一亿技术人!
领取后你会自动成为博主和红包主的粉丝 规则
hope_wisdom
发出的红包
实付
使用余额支付
点击重新获取
扫码支付
钱包余额 0

抵扣说明:

1.余额是钱包充值的虚拟货币,按照1:1的比例进行支付金额的抵扣。
2.余额无法直接购买下载,可以购买VIP、付费专栏及课程。

余额充值