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【MIMIC数据库教程】十、使用Python提取所有患者的尿酸指标(下)
摘要: 在本专栏第九篇文章中,介绍了从MIMIC-IV数据库的Hosp模块的labevents表中提取所有患者的尿酸指标,这篇文还在那个介绍提取ICU模块的chartevents表中提取所有患者的尿酸指标,本文将介绍如何将两个表中的尿酸指标合并为一个表,并保存为CSV文件。
检索ICU模块中尿酸检查的itemid
ICU模块尿酸检查的详细信息包含在d_items表中,表中itemid字段表示检查项目,label字段表示检查名称,尿酸的标准英文是Uric Acid,我们检索d_items表中label字段包含Uric Acid的itemid, 代码如下:
import pandas as pd
# 读取CSV文件
df = pd.read_csv('d_items.csv')
# 检索label中包含'Uric Acid'的行
filtered_df = df[df['label'].str.contains('Uric Acid', case=False, na=False)]
# 将DataFrame转换为Markdown表格
markdown_output = filtered_df.to_markdown(index=False)
# 显示Markdown格式的输出
print(markdown_output)
检索结果如下,尿酸是血液检查,因此确定itemid为221032。
| itemid | label | abbreviation | linksto | category | unitname | param_type | lownormalvalue | highnormalvalue |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 221032 | Lauric acid | Lauric |

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