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【MIMIC数据库教程】九、使用Python提取所有患者的尿酸指标(上)
摘要: 本文以提取患者的尿酸指标为目标,介绍如何使用Python从MIMIC-IV数据库中提取患者的实验室检查指标。
检索尿酸检查的itemid
尿酸检查的详细信息包含在labevents表中,表中itemid字段表示检查项目,valueuom字段表示检查单位。itemid详细信息存储在d_labitems表中,首先需要从d_labitems表中检索尿酸检查的itemid,d_labitems表中包含itemid, label, fluid, category四个字段,尿酸的标准英文是Uric Acid,我们检索d_labitems表中label字段包含Uric Acid的itemid, 代码如下:
import pandas as pd
# 读取CSV文件
df = pd.read_csv('d_labitems.csv')
# 检索label中包含'Uric Acid'的行
filtered_df = df[df['label'].str.contains('Uric Acid', case=False, na=False)]
# 将DataFrame转换为Markdown表格
markdown_output = filtered_df.

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