【MIMIC数据库教程】七、使用Python提取MIMIC-IV患者的真实年龄

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【MIMIC数据库教程】七、使用Python提取MIMIC-IV患者的真实年龄

摘要： 本文以提取患者的真实年龄为例，介绍如何使用Python从MIMIC-IV数据库中提取数据。并做相关的统计可视化。

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提取患者的真实年龄

MIMIC-IV 3.1数据库中患者的信息是经过去隐私化处理的，其中患者的年龄经过偏移，在MIMIC-IV官方给出的数据库创建代码中提供了患者真实年龄的计算方法，如下：

SELECT 	
	ad.subject_id
	, ad.hadm_id
	, ad.admittime
	, pa.anchor_age
	, pa.anchor_year
	, DATETIME_DIFF(ad.admittime, DATETIME(pa.anchor_year, 1, 1, 0, 0, 0), YEAR) + pa.anchor_age AS age
FROM `physionet-data.mimic_core.admissions` ad
INNER JOIN `physionet-data.mimic_core.patients` pa
ON ad.subject_id = pa.subject_id
;

从上面的sql语句中可以看到，患者真实年龄的计算方法是将患者入院时间（admittime）与锚点年份（anchor_year）和锚点年龄（anchor_age）计算得到。下面是通过python提取患者真实年龄的代码，并生成age表及统计患者的年龄分布：

import pandas as