【MIMIC数据库教程】五、MIMIC-IV3.1表格与字段详解(五):ICU模块表格详解


MIMIC-IV 3.1 表格与字段详解(五):ICU模块表格详解

摘要: MIMIC-IV 是一个关系数据库,包含美国马萨诸塞州某三级学术医疗中心的住院患者数据。它继承 MIMIC-III 的基础,提供更丰富的数据,包括实验室测量、用药、生命体征记录等,支持医疗健康研究。但大量繁琐的表格极大地增加了数据处理的难度,本教程将详细介绍 MIMIC-IV 3.1 版本中包含的 31 张表格及其字段,帮助读者更好地理解和使用 MIMIC-IV 数据库。我将在本专栏中持续更新 MIMIC-IV 数据库的详细解读和数据挖掘,敬请关注!


数据模块概述

MIMIC-IV 3.1 版本包含 住院 (hosp) 和 重症监护 (ICU) 两个模块的数据:

  • Hosp: 提供全院电子病历数据,包括入院信息、实验室测量、微生物学、用药、账单等,共计 22 张表
  • ICU: 记录重症监护室数据,如静脉注射、呼吸机设置、生命体征等,共计 9 张表
    在之前的文章【MIMIC数据库教程】一、MIMIC-IV3.1表格与字段详解(一)中整体性的介绍了Hosp和ICU模块中的所有表格,本文将开始对这些表格详细介绍和解读。

🚑 ICU:caregiver表格

caregiver表列出了重症监护病房模块中使用的去标识化的护理人员标识符,总共包含17984行,1个字段,每个字段含义如下:

列名 字段含义 变量类型 缺失值数量
caregiver_id 去隐私化的护理人员ID 整数 0

🚑 ICU:d_items表格

d_items表定义ICU中发生事件的概念,总共包含4095行,9个字段,每个字段含义如下:

列名 字段含义 变量类型 缺失值数量
itemid ICU事件ID 整数 0
label 描述itemid所代表的概念 字符串 0
abbreviation itemid概念的缩写 字符串 0
linksto 提供itemid所链接的数据表名 字符串 0
category itemid对应的类别信息,如“IV Medication”表示静脉注射给药 字符串 0
unitname 该itemid对应事件使用的度量单位 字符串 2972
param_type 描述记录的数据类型 字符串 0
lownormalvalue 该itemid对应事件的参考下界 浮点数 4076
highnormalvalue 该itemid对应事件的参考上界 浮点数 4073

🚑 ICU:chartevents表格

chartevents表记录了患者ICU住院期间的大部分信息,总共包含432997491行,11个字段,每个字段含义如下:

列名 字段含义 变量类型 缺失值数量
subject_id 患者ID 整数 0
hadm_id 住院号 整数 0
stay_id 病房标识符 整数 0
caregiver_id 去隐私化的护理人员ID 整数 15714257
charttime 检查的时间 时间 0
MIMIC-IV 3.1MIMIC-III 以及 eICU 2.0 是常用的公开医疗数据库,分别提供了丰富的临床数据用于科研和教育。这些数据库的安装包通常不直接提供下载,而是需要通过官方渠道申请访问权限后获取。以下是关于这些数据库的获取方式和相关说明: ### 获取方式 1. **MIMIC-IV 3.1 数据库** MIMIC-IV 3.1 是一个关系型数据库,包含住院和重症监护模块的数据,共计 31表格,涵盖了入院信息、实验室测量、用药记录、生命体征等关键临床数据 [^3]。要获取 MIMIC-IV 3.1 数据库的安装包,需通过 PhysioNet 平台申请访问权限,并签署数据使用协议。安装包通常包括创建数据库结构和加载数据所需的 SQL 脚本,如 `create.sql`、`load_7z.sql`、`index.sql` 等 [^4]。 2. **MIMIC-III 数据库** MIMIC-III 是 MIMIC-IV 的前身,也提供类似的临床数据,但结构略有不同。同样,MIMIC-III 的安装包也需要通过 PhysioNet 平台申请获取。安装包包含完整的数据库构建脚本,适用于 PostgreSQL 数据库系统。 3. **eICU 2.0 数据库** eICU 2.0 是另一个类似的临床数据库,专注于重症监护病房(ICU)数据,包含来自多个医疗机构的去标识化患者数据。eICU 数据库的获取方式 MIMIC 类似,需在 eICU 官方网站注册并完成数据使用培训后方可下载。 ### 安装流程 安装这些数据库通常需要以下步骤: - 安装 PostgreSQL 数据库管理系统。 - 下载并解压数据库安装包。 - 执行 SQL 脚本创建数据库结构和加载数据,例如: ```sql -- 创建数据库结构 \i create.sql -- 加载数据 \i load_7z.sql -- 创建索引 \i index.sql ``` 这些脚本通常会包含创建表、加载数据以及建立索引等操作,确保数据库能够高效运行 [^4]。 ### 注意事项 - **数据访问权限**:由于涉及患者隐私,这些数据库的访问受到严格限制,必须通过官方渠道申请并签署数据使用协议。 - **技术要求**:安装和使用这些数据库需要一定的数据库管理经验,特别是对 PostgreSQL 的熟悉程度。
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