【MIMIC数据库教程】三、MIMIC-IV3.1表格与字段详解（三）：Hosp住院模块表格详解(中)

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MIMIC-IV 3.1 表格与字段详解（三）：Hosp 住院模块表格详解（中）

摘要： MIMIC-IV 是一个关系数据库，包含美国马萨诸塞州某三级学术医疗中心的住院患者数据。它继承 MIMIC-III 的基础，提供更丰富的数据，包括实验室测量、用药、生命体征记录等，支持医疗健康研究。但大量繁琐的表格极大地增加了数据处理的难度，本教程将详细介绍 MIMIC-IV 3.1 版本中包含的 31 张表格及其字段，帮助读者更好地理解和使用 MIMIC-IV 数据库。我将在本专栏中持续更新 MIMIC-IV 数据库的详细解读和数据挖掘，敬请关注！

数据模块概述

MIMIC-IV 3.1 版本包含 住院 (hosp) 和 重症监护 (ICU) 两个模块的数据：

  • Hosp: 提供全院电子病历数据，包括入院信息、实验室测量、微生物学、用药、账单等，共计 22 张表。
  • ICU: 记录重症监护室数据，如静脉注射、呼吸机设置、生命体征等，共计 9 张表。
    在之前的文章【MIMIC数据库教程】一、MIMIC-IV3.1表格与字段详解（一）中整体性的介绍了Hosp和ICU模块中的所有表格，本文将开始对这些表格详细介绍和解读。

🏥 Hosp:omr表格

omr表格存储电子病历中记录的各种信息。它是血压、体重、身高和体重指数等门诊测量数据的有用来源,总共包含7753027行，5个字段，每个字段含义如下：

列名 字段含义 变量类型 缺失值数量
subject_id 患者ID 整数 0
chartdate 记录时间 时间 0
seq_num 同一天同类记录的排序号 整数 0
result_name 电子病历中的检查信息 字符串 0
result_value 电子病历中的检查结果 字符串 0

🏥 Hosp:labevents表格

labevents表格存储病人的所有实验室测量结果,其中包括血液学测量、血气、化学检验以及基因检测等不太常见的检验。,总共包含158374764行，16个字段，每个字段含义如下：

列名 字段含义 变量类型 缺失值数量
labevent_id 实验室检查记录ID 整数 0
subject_id 患者ID 整数 0
hadm_id 住院号 整数 73768897
specimen_id 实验室测量样本ID 整数 0
itemid 实验室测量项目ID 整数 0
order_provider_id 下达测量的医护人员ID
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MIMIC-IV官方视图解析-序贯器官衰竭评分（SOFA）
weixin_36172141的博客
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我们的目的是在数据挖掘之后取得进展，最好是来自不同的医疗保健环境，然后是更正式的德尔菲式共识，然后是外部验证——最好是前瞻性的，但最初可能使用现有的数据集。从这个角度来看，我们提出了一些可以在 SOFA 2.0 中考虑的额外元素，同时考虑到保持评分简单且对所有人可用的需要。在 SOFA 2.0 可以安全地替换原始 SOFA 分数之前，需要对每个器官/系统的不同分数的临界值进行全面验证。然而，随着多年来临床实践的变化，SOFA 评分的某些方面可能不再像以前那样重要。正如原始出版物中指出的那样，“
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前言 继MIMIC-III之后，MIT又发布了全新版本的数据库MIMIC-IV。目前版本为V0.4。本文主要对MIMIC-IV进行简要介绍。 引用要求 When using this resource, please cite: Johnson, A., Bulgarelli, L., Pollard, T., Horng, S., Celi, L. A., & Mark, R. (2020). MIMIC-IV (version 0.4). PhysioNet. https://doi.org/
mimic-iv
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模仿iv 收集用于改善患者护理的医疗数据 设置 安装git并签出[git代码存储库] 安装 Python版本3.6+ 将工作目录更改为git代码存储库根目录 创建自包含的conda环境。 在终端中，转到git代码存储库根目录，然后输入以下命令： conda env create --file conda_env.yml src下的所有python模块都必须可用于其他脚本。 这可以通过两种方法来完成。 您可以通过执行以下setup.py命令来设置和安装python模块，该命令会将软件包安装到conda环境site-packages文件夹中，但带有指向src文件夹的符号链接，因此修改将立即反映出来。 python setup.py develop 另外，您可能更喜欢直接从控制台，笔记本电脑，测试脚本等中设置python路径。在Pycharm中，您也可以右键单击src文件夹，然后选
MIMIC-IV v3.1正式发布，修复多个数据问题
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2024年10月11日，广受医学研究者欢迎的MIMIC-IV数据库发布了v3.1版本。本次更新主要针对社区提出的几个问题进行了修复，进一步提升了数据的准确性和一致性。首先，MIMIC-IV v3.1修复了d_labitems表和labevents表中的问题。在v2.2与v3.0版本之间，部分实验室测量项的itemid值发生了意外变化。这一问题已经在最新版本中得到修正，d_labitems和labevents表中的itemid值现已与v2.2版本保持一致。
MIMIC-IV数据库介绍
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MIMIC-IV（Medical Information Mart for Intensive Care) 是一个开放的、大规模的医疗数据库，旨在促进医疗研究和开发的进展。该数据库涵盖了2008至2019年期间的近300,000名患者的临床数据，包括手术、治疗和疾病等方面的信息。数据中包含了包括生命体征、实验室检查、治疗过程、诊断结果、药物使用等大量的医疗信息。
【MIMIC数据库教程】二、MIMIC-IV3.1表格与字段详解（二）：Hosp住院模块表格详解(上)
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MIMIC-IV 3.1 版本包含住院 (hosp) 和 重症监护 (ICU)提供全院电子病历数据，包括入院信息、实验室测量、微生物学、用药、账单等，共计22 张表。记录重症监护室数据，如静脉注射、呼吸机设置、生命体征等，共计9 张表。在之前的文章【MIMIC数据库教程】一、MIMIC-IV3.1表格与字段详解（一）中整体性的介绍了Hosp和ICU模块中的所有表格，本文将开始对这些表格详细介绍和解读。
【MIMIC数据库教程】一、MIMIC-IV3.1表格与字段详解（一）：Hosp和ICU模块表格整体介绍
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03-11 2904
MIMIC-IV 3.1 版本包含住院 (hosp) 和 重症监护 (ICU)提供全院电子病历数据，包括入院信息、实验室测量、微生物学、用药、账单等，共计22 张表。记录重症监护室数据，如静脉注射、呼吸机设置、生命体征等，共计9 张表。
【MIMIC数据库教程】四、MIMIC-IV3.1表格与字段详解（四）：Hosp住院模块表格详解(下)
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03-12 1306
MIMIC-IV 3.1 版本包含住院 (hosp) 和 重症监护 (ICU)提供全院电子病历数据，包括入院信息、实验室测量、微生物学、用药、账单等，共计22 张表。记录重症监护室数据，如静脉注射、呼吸机设置、生命体征等，共计9 张表。在之前的文章【MIMIC数据库教程】一、MIMIC-IV3.1表格与字段详解（一）中整体性的介绍了Hosp和ICU模块中的所有表格，本文将开始对这些表格详细介绍和解读。
【MIMIC数据库教程】五、MIMIC-IV3.1表格与字段详解（五）：ICU模块表格详解
BD_Design_cs的博客
03-12 2335
MIMIC-IV 3.1 版本包含住院 (hosp) 和 重症监护 (ICU)提供全院电子病历数据，包括入院信息、实验室测量、微生物学、用药、账单等，共计22 张表。记录重症监护室数据，如静脉注射、呼吸机设置、生命体征等，共计9 张表。在之前的文章【MIMIC数据库教程】一、MIMIC-IV3.1表格与字段详解（一）中整体性的介绍了Hosp和ICU模块中的所有表格，本文将开始对这些表格详细介绍和解读。
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MIMIC-IV介绍文档，使用笔记 包括对各模块，表格及表格内字段的介绍，以及在使用中遇到的一些值得注意的问题 部分内容可见https://blog.csdn.net/weixin_46523923/article/details/121994699
mimic-iv:有关MIMIC-IV数据库的代码和讨论
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模拟iv代码 有关MIMIC-IV数据库的代码和讨论
MIMIC-IV v2.0数据库
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回顾性收集的医疗数据有机会通过知识发现和算法开发来改善患者护理。为了最大的公共利益，广泛重复使用医疗数据是可取的，但数据共享必须以保护患者隐私的方式进行。重症监护医疗信息集市（MIMIC）-III数据库为进入贝斯以色列女执事医疗中心（BIDMC）重症监护室的40000多名患者提供了重症监护数据。重要的是，根据《健康保险可携带性和责任法案》（HIPAA）安全港规定，MIMIC-III被取消识别，患者标识符被删除。
MIMIC-IV官方视图解析 - AKI 肌酐 (kdigo_creatinine、kdigo_stages)
weixin_36172141的博客
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判断AKI我们可以通过肌酐和尿量两个指标来看， 今天我们主要提取肌酐。AKI是MIMIC相关研究的常用指标，MIMIC数据库里面AKI诊断按照KIDGO指南，内容太多，今天这个只包括肌酐水平评估：MIMIC数据库里面的基线值并不是一个固定的值而是动态的值。主要涉及ICU住院记录icustays和实验室检查labevents两张表。labevents表里CHARTTIME表示测量时间，VALUENUM表示测量值。icustays表里面intime和outtime分别表示出入ICU时间。
MIMIC-IV v3.0 重磅发布：新增2020-2022年住院数据及多项改进
数说时代
07-27 1646
MIMIC-IV v3.0的发布无疑为医疗数据研究带来了更为丰富和准确的数据支持。新增的2020-2022年住院数据以及院外死亡率数据，将为研究人员提供更广泛的研究基础。而语言和保险数据的改进，则提升了数据的精确度和实用性。这一版本的发布，标志着MIMIC-IV数据库在医疗数据领域的又一重大进步。研究人员可以借助这些更新的数据，进一步推动医疗研究的发展，为医疗实践提供更加科学的数据支持。
MIMIC-IV官方视图解析-格拉斯哥昏迷评分（GCS）
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不适用服用安眠药的患者 GCS 评分的评估频次 每 12 小时进行 GCS 昏迷指数评分，对于病情不稳定进展比较快的患者每 4-6 小时评估一次并做好记录。有些刚接触工作的同学，入院评一次，出院评一次，是不正确的，评分主要为了监测病程的演变过程。WITH结构是子查询，相当于将括号内的select语句查询到的结果视为gcs_final这个临时表存在缓存中，注意此时可以将gcs_final看作一个物理表去使用，但是它并不是真实存在在你电脑上的，只是处理过程中的一个临时表，但是使用方法还是一样的。
MIMIC-IV数据库安装-3.0/3.1
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7-zip：配置环境变量（安装路径）Postgressql：配置环境变量（安装路径/bin）Navicat。
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‍近年来，用公共数据发文已经成为国人发文的重要方式。而随着发文量的增加，中国学者们也将发文方法“卷”上了新的高度。今天分享的文章中国学者又开始“搞事情”，用了三个国际队列，MIMIC-IV数据库做验证，发文一区！2024年7月2日，中国学者用MIMIC-IV数据库，在期刊《International Journal of Surgery》（医学二区，IF=12.5）发表题为：“Associatio...
MIMIC-IV- v2.0带着随访数据来啦
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MIMIC IV数据库安装（一）
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mimic iv 数据库安装
mimic-iv 3.1 +iii+eICU2.0 数据库安装包
最新发布
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MIMIC-IV 3.1、MIMIC-III 以及 eICU 2.0 是常用的公开医疗数据库，分别提供了丰富的临床数据用于科研和教育。这些数据库的安装包通常不直接提供下载，而是需要通过官方渠道申请访问权限后获取。以下是关于这些数据库的获取方式和相关说明： ### 获取方式 1. **MIMIC-IV 3.1 数据库** MIMIC-IV 3.1 是一个关系型数据库，包含住院和重症监护模块的数据，共计 31 张表格，涵盖了入院信息、实验室测量、用药记录、生命体征等关键临床数据 [^3]。要获取 MIMIC-IV 3.1 数据库的安装包，需通过 PhysioNet 平台申请访问权限，并签署数据使用协议。安装包通常包括创建数据库结构和加载数据所需的 SQL 脚本，如 `create.sql`、`load_7z.sql`、`index.sql` 等 [^4]。 2. **MIMIC-III 数据库** MIMIC-III 是 MIMIC-IV 的前身，也提供类似的临床数据，但结构略有不同。同样，MIMIC-III 的安装包也需要通过 PhysioNet 平台申请获取。安装包包含完整的数据库构建脚本，适用于 PostgreSQL 数据库系统。 3. **eICU 2.0 数据库** eICU 2.0 是另一个类似的临床数据库，专注于重症监护病房（ICU）数据，包含来自多个医疗机构的去标识化患者数据。eICU 数据库的获取方式与 MIMIC 类似，需在 eICU 官方网站注册并完成数据使用培训后方可下载。 ### 安装流程 安装这些数据库通常需要以下步骤： - 安装 PostgreSQL 数据库管理系统。 - 下载并解压数据库安装包。 - 执行 SQL 脚本创建数据库结构和加载数据，例如： ```sql -- 创建数据库结构 \i create.sql -- 加载数据 \i load_7z.sql -- 创建索引 \i index.sql ``` 这些脚本通常会包含创建表、加载数据以及建立索引等操作，确保数据库能够高效运行 [^4]。 ### 注意事项 - **数据访问权限**：由于涉及患者隐私，这些数据库的访问受到严格限制，必须通过官方渠道申请并签署数据使用协议。 - **技术要求**：安装和使用这些数据库需要一定的数据库管理经验，特别是对 PostgreSQL 的熟悉程度。
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