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跟着Cell学单细胞转录组分析(五):单细胞转录组marker基因鉴定及细胞群注释 书接上回(跟着Cell学单细胞转录组分析(四):单细胞转录组测序UMAP降维聚类)。完成数据降维和细胞聚类后,最主要的环节和工作就是确定各个细胞群,明确是什么类型的细胞,正群的细胞定群很关键,涉及到整个研究,所以这一步宁愿多费时间,也不要出错。当然,这也不是一蹴而就的,需要反复的确认。 要确定各个群是什么细胞,首先需要了解细胞群的marker基因,因为不同类型的细胞突出 表达的基因也是不同的。这里使用FindAllMarkers鉴定各个细胞群的高表达基因。 DefaultAssay(scedata) 阅读详情

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