将医学图像.dcm格式与.nii.gz格式进行一些处理

介绍

• .dcm文件是一种医学上用于存储CT、核磁共振等成像方式得到的患者器官图像的文件格式
• .nii.gz是通过标注软件导出的3D标签(可以看作一个np数组)

我们通过pydicom和nibabel这两个包来辅助我们进行操作

1. 读取dcm数据并用plt显示

# 读取dcm数据并使用plt显示

# ······································ #
fpath = ""
ds = pydicom.dcmread(fpath)
new_image = ds.pixel_array
scaled_image = (np.maximum(new_image, 0) / new_image.max()) * 255.0
plt.figure(figsize=(10, 10))
plt.imshow(scaled_image, cmap=plt.cm.bone)
plt.show()