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原创 群落构建机制/过程(1)

而中性理论认为,微生物群落构建主要受到随机出生、死亡、定殖、灭绝和物种形成的驱动。最近提出的过程理论则认为,微生物群落构建主要由四个生态过程决定:选择、扩散、漂变和多样化。图1 | 低级群落过程构成高级群落过程,并最终描绘群落动态过程(a)以及这些生态过程中的确定性和随机性(b) (修改自Mark Vellend, 2016;是最近开发出的基于系统发育分箱的零模型算法,主要用于揭示微生物子群落的构建机制。例如:植物促生菌的子群落构建主要受到扩散限制的控制,通过具有针对性的接种可以潜在地增加它们的多度。

2024-03-04 14:22:02 1572 1

原创 氮富集通过介导植物生物量和根系分泌物刺激根际多元素循环基因

C、N、P和S循环基因丰度随氮添加速率的增加而增加,主要受植物生物量和根系分泌物变化的调控。土壤可溶性有机碳的量对决定C、N、P和S循环相关基因的丰度起着至关重要的作用,植物生物量通过增加根系分泌物中的有机酸和溶解性有机碳间接影响基因丰度。使用微阵列GeoChip分析,分别检测到2676、744、308和515个基因探针,分别涉及碳(C)、N、磷(P)和硫(S)循环。采用偏最小二乘法路径模型(PLS-PM)研究了在添加氮的条件下,土壤和植物特征对 C-、N-、P-和 S-循环基因的影响。

2024-01-05 11:52:10 894 1

原创 20240104学习笔记

基因探针,即核酸探针,是一段带有检测标记,且顺序已知的,与目的基因互补的核酸序列(DNA或RNA)。GeoChip是根据微生物线管的各类功能基因独立设计的特异性探针,能极大地降低动植物宿主基因组的干扰,且具有平行样品间结果高重现性和高灵敏度的特点,适用于探索已知基因及物种的未知规律。基于全球基因组公共数据库并针对与地球化学过程中具体途径靶向相关的各类功能基因设计特异性的寡核苷酸探针,对待测样品的功能基因进行预测评估利用这些预测探针的信号强度总和反映基因的功能性代谢潜能(即基因丰度)。

2024-01-04 20:40:15 889 2

空空如也

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