前段时间研究过如何求最长连续公共子序列和最长连续子字符串,以前一个同学正好问起来,这里贴出来解法:
问题的关键还是如何定义子问题,
假设有:
Xm = x1 x2 x3 ... xm
Yn = y1 y2 y3 ... yn
1. 最长公共子序列(不必连续)
定义f(m, n)为Xm和Yn之间最长的子序列的长度
于是有f(m, 0) = f(0, m) = 0
如果xm != yn, 则f(m, n) = max{ f(m-1, n), f(m, n-1) }
如果xm = yn,则f(m, n) = f(m-1, n-1) + 1
问题归结于求f(m, n)。依照公式用Bottom-up Dynamic Programming可解
2. 最长子字符串(必须是连续的)
定义f(m, n)为Xm和Yn之间最长的子字符串的长度并且该子字符串结束于Xm & Yn。因为要求是连续的,所以定义f的时候多了一个要求字符串结束于Xm & Yn
于是有f(m, 0) = f(0, m) = 0
如果xm != yn, 则f(m, n) = 0
如果xm = yn, 则f(m, n) = f(m-1, n-1) + 1
因为最长字符串不一定结束于Xm / Yn末尾,所以这里必须求得所有可能的f(p, q) | 0 < p < m, 0 < q < n, 最大的f(p, q)就是解。依照公式用Bottom-up Dynamic Programming可解
本文介绍了求解最长公共子序列与最长连续子字符串的动态规划方法。通过定义子问题并递推求解,最终得出解决方案。适用于解决相似序列比对问题。
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