基因转录调控网络——转录因子调控网络分析
转录因子(Transcription Factors, TFs)是指
能够以序列特异性方式结合DNA并且调节转录的蛋白质。
转录因子通过识别特定的DNA序列来控制染色质和转录,以形成指导基因组表达的复杂系统。
转录水平的调控是基因调控的重要环节,其中转录因子(Transcription Factor,TF)和转录因子结合位点(Transcription Factor Binding Site,TFBS)是转录调控的重要组成部分。
基因转录调控网络由于其可以直观地显示基因表达调控关系,已成为生物学研究的热点之一。近年来,随着高通量测序技术的发展,产生了大量用于鉴定转录因子及其结合位点的高通量实验数据。为了系统地收集、整理和分析这些数据,产生了许多相关的转录因子数据库。 转录因子占所有人类基因的约8%,并且与多种疾病和表型相关。因此基因转录调控网络分析将为基因调控、组织分化、疾病发生等相关研究提供了必要的数据参考。
主要应用领域:基因调控分析、疾病研究(例如疾病产生和发展机制,组织分化等)、进化分析(表观遗传)
分析过程简图:

补充:几个组学概念
如下图所示:
转录调控网络是生物学研究的重要领域,涉及转录因子和TFBS,与基因表达、疾病机制及进化分析密切相关。高通量测序技术的发展促进了转录因子数据库的建立,为基因调控分析、疾病研究和进化分析提供数据支持。转录组学研究基因转录情况,蛋白质组学关注蛋白质表达,代谢组学分析代谢物变化,表观遗传学探讨非序列改变的遗传表达,而功能基因组学则系统研究基因功能。这些组学研究共同揭示生命活动的复杂规律。
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