m6A甲基化及预测方法工具总结

最新推荐文章于 2025-03-14 15:39:22 发布

AIPuFu

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分类专栏：生物信息学生物学医学文章标签：生物信息学生物学医学计算机统计学

本文链接：https://blog.youkuaiyun.com/AIPuFu/article/details/100821644

本文总结了RNA N6-腺苷酸甲基化（m6A）的生物学意义及其在疾病中的作用，并列举了多个用于预测RNA m6A甲基化位点的工具，包括iRNA-Methyl、SRAMP、iRNAm5C-PseDNC、M6AMRFS、M6APred-EL和DeepM6ASeq。此外，还介绍了一个用于功能预测的工具m6Acomet，帮助研究人员更有效地预测和注释m6A甲基化位点。

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DNA、RNA和蛋白三个层面的可逆修饰示意图（Fu et al. Nature Reviews Genetics, 2014）

DNA和蛋白存在各种修饰，RNA也不例外，目前已知的RNA修饰已经超过上百种。RNA根据编码性可分为编码RNA（protein-coding RNA）和非编码RNA（noncoding RNA）两大类，这些RNA转录后会发生各种修饰，包括N6-腺苷酸甲基化（N6-methyladenosine，m6A）、胞嘧啶羟基化（m5C）、N1-腺苷酸甲基化（m1A）等等。m6A甲基化是真核生物RNA中最常见的一种转录后修饰，大约占到了RNA甲基化修饰的80%左右。

真核生物中mRNA的各种化学修饰（Roundtree et al. Cell, 2017）

m6A甲基化和去甲基化（A）及对下游protein-RNA相互作用的影响（B）（Roundtree et al. Cell, 2017）

近几年来，RNA甲基化逐渐当今最热门的研究领域之一。因为m6A甲基化的功能至关重要，其异常会与各种疾病的发生、发展密切相关，包括肿瘤或癌症、各种神经性疾病、胚胎发育迟缓等。关于RNA甲基化的文章现在呈现出来了井喷式增长，很多都是发在Nature，Science, Cell等顶级期刊上。