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原创 什么是小提琴图?手把手教你看懂小提琴图
小提琴图,外层为核密度图,内层为箱线图。形似小提琴,故名小提琴图。是一种用来显示数据分布情况的统计图表。外层核密度图:它用来显示数据的密度分布,像是一个平滑的直方图,能帮助我们看出数据的分布情况。轮廓宽的地方说明这个数值范围内的数据比较多,窄的地方则表示数据比较少。内层箱线图:它展示了一组数据的五个统计特征:下限、第一四分位数(Q1)、中位数、第三四分位数(Q3)和上限。外面的黑点显示离群值的存在和分布情况。四分位数。
2025-03-21 08:50:34
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原创 什么是韦恩图?一文看遍所有种类的韦恩图
简单来说,用重叠圆圈表示不同集合的交集/并集。韦恩图(Venn Diagram)是一种用于展示集合之间关系的图形工具。它通过重叠的圆形来表示不同集合及其交集。每个圆代表一个集合,圆与圆之间的重叠部分则表示这些集合的交集。在组学中的应用场景:韦恩图常用于展示组内或组间的交集、并集情况,帮助分析和比较数据之间的相似性与差异性。通常,韦恩图展示2至4个集合最为合适,以确保图形简洁、易于理解。有没有发现一个问题,当集合个数超过4个时,已经很难看清集合的交并集关系。此时传统的韦恩图已经不适合了,那么该怎么办呢?
2025-03-06 16:15:05
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原创 什么是差异分析?手把手教你理解差异分析
差异分析就是,判断哪些基因在两组数据间存在显著差异。如图就是一份差异分析后的结果。从这份结果中,我们可以直观地看到各个基因的FC值、P值和FDR值。什么是FC?翻译成中文是差异倍数(Fold Change),也被称作Ratio。
2025-02-24 15:31:37
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原创 什么是箱线图?手把手教你看懂箱线图
箱线图(Box plot)是一种用来显示数据分布情况的统计图表。它展示了一组数据的五个统计特征:下限、第一四分位数(Q1)、中位数、第三四分位数(Q3)和上限。外面的黑点显示离群值的存在和分布情况。四分位数(quartile)是指在统计学中把所有数值由小到大排列并分成四等份,处于三个分割点位置的数值。四分位数也被称为四分位点,它是将全部数据分成相等的四部分,其中每部分包括 25%的数据,处在各分位点的数值就是四分位数。
2025-02-15 14:20:33
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原创 什么是热图?手把手教你看懂热图
如图,就是一副组学研究中热图的常用绘制模式,每个小方格表示每个基因在不同样本中的定量值,其颜色表示该基因表达量大小,红色为高表达,蓝色为低表达。行名称:通常为样本名称。列名称:通常为基因名称。图例信息:左侧图例表示热图表达量的颜色说明,右侧图例展示分组信息。热图绘制过程中通常会进行Z-score归一化处理,因此图例数据显示为0左右对称分布,这表示已进行Z-score标准化。列聚类:如果不进行聚类,列的排序将保持原始数据的顺序。通过聚类可以判断不同组别的样本是否被正确分组。
2025-02-07 15:44:53
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