Windows11_WSL2_FSL_ANTs

1）可选功能》更多》适用于Linux的Windows子系统、虚拟机平台，重启；

Install wsl2

2）windows powershell》 

wsl --install -d Ubuntu

wsl --install -d Ubuntu 无法解析服务器的名称或地址-window11_wsl --install 无法解析服务器的名称或地址-优快云m

同意协议后会自动下载linux与wsl2；

\\wsl.localhost\Ubuntu-24.04\home\even，可放相关数据 ；

Install fsl

3）FSL Software Downloads (ox.ac.uk)

下载后放入上述路径；

4）powershell>wsl>sudo apt update>python3 ./installed/fslinstaller.py;

Check

5) restart ubuntu>

source /etc/bash.bashrc>

source /etc/profile>

echo $FSLDIR>

flirt -version>

which imcp>

/usr/local/fsl/bin/imcp>

fsl

安装XLaunch

6）VcXsrv Windows X Server download | SourceForge.net

wsl>sudo apt-get update && sudo apt-get upgrade -y>sudo apt-get install xfce4 -y>sudo apt-get install xfce4-goodies -y;

7)打开XLaunch>One large window>Display number 0>next>disable acess control

8）wsl>

vim ~/.bashrc文件末尾添加以太网ip4（vim方法：i，编辑，esc，:wq!修改并保存文件）>

source .bashrc或重新进入wsl>

startxfce4;

测试图像的处理

9）sudo chmod 777 -R ./MYDOC/img

10）fsl.

the END.

P.S.:

1) permission denied

sudo passwd

su root

2）jupyter

在 WSL2 上安装 Anaconda 并使用 JupyterLab - Blog - Silicon Cloud (silicloud.com)

ANTs 

git clone https://github.com/ANTsX/ANTs.git

mkdir antsbin

cd antsbin

ccmake ../ANTs

c →SuperBuild_ANTS_USE_GIT_PROTOCOL，BUILD_TESTING，RUN_LONG_TESTS,RUN_SHORT_TESTS ：OFF → c → g

# make -j 4

sudo make -j 2 2>&1 | tee build.log

cd ANTS-build

sudo make install 2>&1 | tee install.log

cd ../ # to antsbin/

# check antsbin/bin/, or mkdir

mkdir bin # (cd  xx/antsbin/)

cp ./ANTS-build/Examples/* ./bin

cp ./ANTS-build/Examples/* ./bin  -r

cp ./staging/bin/* ./bin

cp ../ANTs/Scripts/* ./bin

vim ~/.bashrc

export ANTSPATH=/home/even/antsbin/bin/  # 添加到末尾 （i，esc，:wq!）
export PATH=${ANTSPATH}:$PATH

source ~/.bashrc # 环境变量生效

check

antsRegistrationSyN.sh

Refer.

win11 安装wsl2|极客笔记 (deepinout.com)

通过 VcXsrv 在 WSL2 上使用图形化界面（xfce4） - bluenlq - 博客园 (cnblogs.com)

LInux环境下ANTs软件安装_ants linux 安装教程-优快云博客

医学图像配准软件 ANTs（Advanced Normalization Tools）的安装和使用说明-优快云博客