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原创 线性模型-分类

线性判别分析是一种经典的线性学习方法,在二分类问题上最早是Fisher提出的,亦称为Fisher判别分析。Fisher判别分析是一种用于降维和分类的统计方法,旨在找到可以最好区分不同类别的特征。它基于类内方差和类间方差的比值来选择最佳的投影方向,从而实现数据的最佳分类思想:将训练集的样本投影到一条直线上,使得正类和反类投影在直线上的距离尽可能的分开。当测试集的样本被投影到直线上的时候,通过观察他的位置就可以知道该测试集的样本属于哪一类。示意图"+"、"-"分别代表正例和反例,椭圆表示数据。

2024-06-06 11:44:45 1062

原创 模型评估指标计算和常见编码

我先学习一下ilearnPlus平台是如何使用的。

2024-05-30 15:03:09 350

原创 通过MEGA构建系统发育树

本研究通过分析13个生物物种的CYTB蛋白序列,构建了系统发育树,初步揭示了这些物种在进化过程中的亲缘关系。似乎鱼类动物与哺乳动物的亲缘关系近,两栖动物与爬行动物的亲缘关系更近。CYTB作为一个适中进化速率的分子标记,在探讨生物进化史方面具有重要价值。未来可进一步扩大样本量,结合其他基因序列数据,对生物进化的历史轨迹进行更加深入和全面的研究。

2024-05-28 00:00:00 3633

原创 复习健康医疗大数据

hadoop分布式文件系统名称节点、数据节点HDFS的分块处理数据块——128优点:1可以保存在多个存储设备上 ,从而支持超大规模的存储2利于数据复制,快速备份,利于数据的分布式计算HDFS数据读写流程:数据分块;获取数据块副本存放位置;写入数据块。

2024-05-22 21:48:17 724

原创 关于HTK下载、编译、实例

写这篇博客,是因为我很感激我身边的老师和朋友和这个世界,对于一个初学者,一切对我来说,都是看似困难的,因为前端时间我一直都在希望着,我的同学做完了,可以来指导我。所以我的作业一直没有进度。后来我认为是我练习的时间太少了。因此今天下午,我决心一做,成功了一大半了,很开心。很感激。进入正题吧。

2024-05-19 00:31:57 1262

原创 西瓜书-第三章·线性模型-回归问题

看到这个标题,我首先就想到了线性相关,这个模型是否就是类似于一个线性方程。

2024-05-16 16:33:12 541

原创 西瓜书-第二章·模型评估与选择

在上一章我们知道了什么是机器学习。其中我们提到了最重要的是算法学习,当我们用算法得到某种模型的时候,我们可以如何去判断他的一个好坏呢?因此接下来我们继续学习-模型评估与选择。

2024-05-07 20:08:49 872

原创 常见算法之决策树

一棵决策树包含一个根节点,若干个内部节点,和若干个叶节点。叶节点对应决策结果。决策树有时候也称为判定树。有时候指学习方法,有时候指学的的树。决策树学习的目的就是产生一颗泛化能力强的的决策树。还是先来理解西瓜书中的决策树。基本流程遵循分而治之。

2024-04-27 23:28:51 188

原创 常见算法之 K近邻

因为它没有显式的训练过程。仅仅只是把样本保存起来,训练时间开销为0,等到收到样本后才开始处理。2.给定的测试样本进去预测(分类任务中常用“投票法”)(回归任务常用“平均法‘)K近邻简称KNN——属于监督学习。因此在训练集中肯定是有标签的,我的想法是先去看一下西瓜书对K近邻的讲解,再去看看代码实现。3.预测结果:将这K个样本中出现最多的类别标记作为预测结果。“近朱者赤,近墨者黑”

2024-04-26 15:07:33 191 1

原创 西瓜书-第一章绪论

什么是机器学习?我去问了一下我身边没有接触过机器学习的人,问他们认为机器学习是什么?小杜同学:机器学习是不是AI自己学习,自己更新自己。小李同学:是一个专业的东西,机器学习的过程,是不是还是认为 的去打代码。其实在你思考这个问题的时候,是不是在利用我们已知的经验去回答这个问题的过程。再比如:大人们去超市买西瓜的时候,他们总能选到又甜又多汁的西瓜,而我去我只能装模做样的敲两下。他们为什么能够选到好西瓜呢?

2024-04-25 13:54:53 934 1

原创 SARS-CoV-2 receptor ACE2 and TMPRSS2

用single nuclei and single cell RNA sequencing方法在肺和支气管中测序ACE2和TMPRSS2介绍了SARS-Cov2是包膜病毒粒子,SARS-CoV-2也会在体外与ACE2结合。

2023-09-10 11:04:37 155 1

原创 使用虚拟机安装R语言

安装次数过多,包也没有更新,因此第三个BiocManager一直没有安装成功。127.0.0.1:8787 在浏览器搜索 进入Rstudio。1.打开虚拟机的ubuntu的终端进行网络测试。输入:ping www.baidu.com。下载成功 rstudio 后利用自己的网址。②:重新下载R语言及以上四个安装包。安装的过程可能很慢需要耐心等待。成功安装R后持续安装以下包安装。③:调试虚拟机网络环境。点击端口转发规则,并修改。3.安装Rstodio。

2023-09-03 20:32:02 432

原创 使用结构化命令

then echo "该用户已存在" echo "用户信息:" id "$username" else # 检查/home下是否有该用户的文件夹 if [ -d "/home/$username" ];then echo "用户文件夹已存在,内容如下:" ls -la "/home/$username" else # 创建用户 useradd "$username" echo "新用户已创建" echo "用户信息:" id "$username" fi fi。test命令可以判断三类条件: 数值比较;

2023-07-16 23:27:46 130

原创 构建基本脚本

1. 构建一个脚本文件 执行 创建新用户、给新用户分组、查看当前登录的用户。用绝对或者相对路径来引用shell脚本 ./要显示美元符,你必须在它前面放置一个 反斜线。1.在shell脚本中用方括号执行以下数学运算。ls ./*.txt 显示所有txt 的文件。3. 为刚刚构建的脚本文件添加输出前的提示。隔开两个命令 date;2. 运行该脚本文件查看返回结果。/bin/bash(固定)使用 > 新文件会覆盖全部文件。expr 命令或使用方括号。使用 >> 可以追加文件。|直接重定向到另一个命令。

2023-07-11 11:44:37 121

原创 使用Vim 编辑器指南

① 查找你的姓名/学号 ② 替换文件中全部vim为vi(或替换vi为vim)② 如何进入和退出编辑模式,如何保存文本;1. 使用vim编辑器或vi编辑器创建一个txt文本文件。一、查看你所用的Linux系统是哪种vim软件包。当你要打开要编辑的文件时便进入了普通模式。vim 1.txt(创建文件)②vim查找(在普通模式)③vim替换(在普通模式)y yw 复制单词。

2023-07-10 11:08:48 2147

原创 理解Linxu文件权限

常见的配置文件包括应用程序的设置、服务器的配置、系统的环境变量等。这些文件可能保存着用户创建的数据、应用程序的设置、日志文件等等。例如,一些具有可执行权限的脚本文件、二进制可执行文件或编译后的程序文件。文档文件(documentation files):这些文件包含了关于软件、应用程序或系统的使用指南、帮助文档、手册等信息。程序库文件(library files):这些文件是用于在软件开发中共享代码和函数的文件。日志文件(log files):这些文件用于记录应用程序、系统或其他实体的活动日志。

2023-07-09 14:41:43 219

原创 使用Linux环境变量

要引用一个单独的数组元素,就必须用它在数组中位置的数值索引值。2. 在子shell中设置局部变量,退出 子shell后在父shell中查看。4. 在子shell中使用export将赋新值的变量导出至全局并查看。5. 进入子shell,在子shell中查看$PWD变 数组变量。1. 在父shell中设置局部变量,进入 子shell中查看。1. 进入子shell中查看父shell中设置的全局环境变量。3. 退出子shell,查看父shell中的该变量值。5. 退出子shell,查看父shell中的该变量。

2023-07-07 13:26:24 586

原创 复习练习。

4.cd /mnt/d/(文件名)进入该文件查看。5.ls -l 查看该文件下的文件。cd /mnt/c进入C盘访问。1.pwd 查看当前所在位置。cd .. 可以返回根目录。3.ls 查看D盘中的内容。mkdir 可向其中加入。ls -l当前下的文件。进入mnt 的d 盘。df -h 查看挂载。

2023-07-06 10:42:44 67

原创 理解shell

命令分为内建命令和外部命令。非内建(外部)命令:有时候也被称为文件系统命令,是存在于bash shell之外的程序。它在后台生成一个子shell,并在这个子shell中执 行命令。后台模式:运行命令可以在处理命令的同时让出CLI,以供他用。要想将命令置入后台模式,可以在命令末尾加上字符&)可以在一行中指定要依次运行的一系列命令。命令列表命令包含在括号里,生成一个子shell来执行对应的命令。是一个命令,用于将当前会话的命令历史记录保存到历史记录文件。命令直接显示当前会话的命令历史记录,而不是依赖于文件。

2023-07-05 14:56:09 87 1

原创 今日份挂载记录

2023-07-05 13:54:44 73 1

原创 今天学习bash shell 命令

从左到右名称:UID:启动用户;PPID:父进程ID;STIME:启动时间;从左到右:进程ID;进程占用虚拟内存总量,进程占用物理内存总量;进程使用CPU时间比例;在操作此步骤时,输入 mount -t type device directory .时文件不存在,待解决。-n匹配模式行在行号;-c 有多少行含有匹配模式;-c 文件总大小 -h易读格式输出大小 -s 每个参数总计。2.处理数据文件时无法定位文件,因此无法处理。对新建的文件进行排序出现问题,待解决。1.查看挂载磁盘的时候,无法查看。

2023-07-05 11:28:55 129 1

原创 【无标题】WSL2

与传统虚拟机相比,WSL 2在性能和资源利用方面有一定的优势,可以提供更好的性能和更接近原生的Linux环境。而WSL 2主要用于在Windows操作系统上运行Linux应用程序和开发环境,它提供了更好的集成性和性能,并且可以直接访问主机文件系统和网络。譬如:在命令行中输入: wsl.exe –list –all wsl.exe –unregister Ubuntu-22.04(这个根据你的版本写) #下载成功了真的很开心 3.下载你的版本的Ubuntu 启动后要等几分钟,然后再设置你的名字。

2023-07-04 13:49:25 1289 1

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