藻类孢子运动模式分类研究
1. 粒子深度位置分辨率与轨迹确定
在研究粒子的运动时,提高粒子深度位置(z - 位置)的分辨率是一个重要的课题。采用传统方法,将粒子的最大值视为其中心。不过,也有更复杂的方法被开发出来,这些方法还能处理不同粒子大小的情况。而通过形态学滤波,算法能更灵活地适应不同情况。
当获得最终的粒子位置后,需要进行最后一步来确定轨迹。这里使用标准的匈牙利算法来匹配第 i 帧到第 i + 1 帧的粒子。
2. 隐马尔可夫模型(HMM)基础
隐马尔可夫模型是一种广泛应用于人工智能、语音和模式识别以及生物过程建模等领域的统计模型。在 HMM 中,假设被建模的系统是一个具有未观察状态的马尔可夫过程,这个隐藏的随机过程只能通过另一组产生符号序列 O = o1, o2, …, oM 的随机过程来观察。
一个 HMM 由 N 个状态 S1, S2, …, SN 组成,系统在任何给定时间处于其中一个状态。每个 HMM 可以由三元组 λ = (Π, A, B) 定义:
- Π = {πi} 是初始状态概率向量。
- 从 Si 到 Sj 的每个转移都有一个概率 aij,且 ∑j aij = 1,A = {aij} 是状态转移矩阵。
- 每个状态 Si 以概率分布 bik = P(ok|Si) 生成一个输出 ok,B = {bik} 是发射矩阵。
与 HMM 相关的三个主要问题及解决方法如下:
1. 评估问题 :对于一个观察序列 O,计算 HMM λ 生成 O 的概率 P(O|λ),使用前向 - 后向算法解决。
2. 估
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